在执行程序中，若厂房等被执行人的财产经过法定拍卖程序流拍，债权人确实有权向法院申请以该流拍财产抵偿债务。以下是对这一流程的详细解析：

一、前提条件

1. 确认流拍：首先，必须明确厂房的拍卖已经流拍，即没有买家以设定的起拍价或更高价格购买该财产。

2. 提出申请：债权人需向负责执行的法院提交书面申请，明确表示愿意以流拍财产抵偿债务。申请中应详细说明抵债的金额、范围及相关条件。

二、法院审查与评估

1. 合法性审查：法院将全面审查申请的合法性，包括执行依据的有效性、执行程序的正当性，以及申请主体的资格等。

2. 价值评估：

   • 法院会重新评估流拍厂房的市场价值，考虑其市场行情、使用现状、折旧程度等因素，以确保抵债价格的公平公正。
   • 同时，法院会核查是否存在其他享有优先受偿权的债权人，并确定各债权人的受偿顺序和比例。

三、意见征询与裁定

1. 被执行人及其他债权人意见征询：

   • 法院会告知被执行人以物抵债的申请，并征求其意见。
   • 同时，通知其他已知债权人，包括普通债权人和享有优先受偿权的债权人，询问他们是否同意该方案。

2. 作出裁定：

   • 经过全面审查，如果法院认为以物抵债申请符合法律规定，且不损害其他债权人权益，将作出以物抵债的裁定。
   • 裁定书中将明确抵债厂房的基本信息、抵债金额及债务抵偿情况等内容。

四、产权转移与交付

1. 产权转移：

   • 裁定生效后，相关部门将协助办理产权过户手续。对于不动产如厂房，需到不动产登记机构办理产权变更登记。
   • 申请执行人或接受抵债的债权人需按规定提供必要文件和资料，并缴纳相应税费。

2. 财产交付：

   • 被执行人应按裁定要求将抵债厂房交付给申请执行人或接受抵债的债权人。
   • 如被执行人拒不交付，法院可采取强制执行措施，如强制迁出房屋等。

五、特殊情况处理

1. 多个债权人申请：若存在多个债权人且都申请以物抵债，法院将根据债权人的债权比例或其他公平原则来确定各自应得的份额。

2. 权利瑕疵处理：如果流拍厂房存在产权不清晰、其他优先受偿权等权利瑕疵，法院可能会根据具体情况决定是否支持债权人以物抵债的申请。

3. 差额部分处理：当厂房的价值与债权金额不完全相等时，法院需要对差额部分进行处理，可能涉及债权人补足差额或债务人继续承担剩余债务的情况。

六、总结与建议

拍卖流拍后，债权人申请以物抵债是一个复杂而细致的过程，需要遵循严格的法律程序和规定。在实际操作中，债权人应充分了解相关法律法规和操作流程，并积极与法院沟通协作，以确保自身权益得到有效保障。同时，也应注意处理可能出现的特殊情况和权利瑕疵，以确保整个过程的合法性和有效性。如有需要，建议咨询专业律师或法律机构以获取更具体的法律建议和帮助。