结论前置：买回迁房时，若对方不肯过户，法院判决其支付违约金是合法的，但具体是否判决违约金以及违约金的数额，需根据合同约定、实际损失情况及法律规定综合判断。

详细分析：

1. 合同约定：

   • 在房屋买卖合同中，双方通常会就过户时间、违约责任等条款进行明确约定。如果合同中明确规定了若卖方不肯过户，需支付一定数额的违约金，那么当卖方违约时，买方有权依据合同约定要求卖方支付违约金。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条：“当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。”

2. 实际损失情况：

   • 即使合同中没有明确约定违约金数额，但如果买方因卖方不肯过户而遭受了实际损失（如租房费用、购房机会成本等），买方也有权要求卖方赔偿这些损失。在司法实践中，法院可能会根据买方的实际损失情况，酌情判决卖方支付一定数额的违约金或赔偿金。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第五百八十四条：“当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定，造成对方损失的，损失赔偿额应当相当于因违约所造成的损失，包括合同履行后可以获得的利益；但是，不得超过违约一方订立合同时预见到或者应当预见到的因违约可能造成的损失。”

3. 法律规定：

   • 在房屋买卖纠纷中，法院会综合考虑合同约定、实际损失情况以及相关法律法规的规定，来判决卖方是否应支付违约金以及违约金的数额。如果卖方不肯过户的行为构成了违约，且买方因此遭受了损失，那么法院判决卖方支付违约金是合法的。
   • 特殊情况：如果合同中约定的违约金过高或过低，法院可能会根据《中华人民共和国民法典》第五百八十五条第二款的规定，对违约金数额进行调整，以确保其合理性。

法律建议：

• 保留证据：在房屋买卖过程中，买方应妥善保留与交易相关的所有证据，如合同、付款凭证、沟通记录等，以便在发生纠纷时能够证明自己的权益。
• 及时咨询：如果遇到卖方不肯过户的情况，买方应及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能的法律后果和解决方案。
• 协商解决：在可能的情况下，买方可以尝试与卖方进行协商，寻求和解或达成新的协议，以避免不必要的法律纠纷和损失。

可能后果：

• 如果法院判决卖方支付违约金，卖方需按照判决履行支付义务。如果卖方拒不履行，买方可以申请法院强制执行。
• 如果因卖方不肯过户导致买方无法取得房屋所有权，买方还可以要求卖方承担其他法律责任，如返还购房款、赔偿损失等。

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