结论：不建议您不签协议就撤设，即便培训机构已退回部分学费。以下从多个角度为您详细分析：

从法律风险防范角度

1. 协议是明确双方权利义务的重要依据：签订协议可以清晰地界定您和培训机构之间关于学费退还、撤设等事项的具体约定。比如，协议中可以明确剩余学费的退还时间、方式，以及撤设后双方不再存在其他纠纷等内容。如果没有协议，一旦后续培训机构反悔，不承认之前与您的口头约定，或者对剩余学费的退还产生争议，您将面临举证困难的问题，难以有效维护自己的合法权益。
2. 避免潜在纠纷：在现实生活中，口头约定往往存在不确定性。即使培训机构现在同意退回部分学费并让您撤设，但如果没有书面协议固定下来，后续可能会出现各种意想不到的情况。例如，培训机构可能以各种理由拖延退还剩余学费，或者声称您撤设后仍需承担某些费用等。而有了书面协议，这些问题都可以在协议中得到明确解决，减少纠纷发生的可能性。

从实际操作角度

1. 保障退款流程顺利进行：签订协议可以规范退款流程，确保培训机构按照约定的时间和方式退还剩余学费。协议中可以约定退款的具体账户信息、退款期限等，一旦培训机构未按照协议履行退款义务，您可以依据协议向其主张权利，甚至通过法律途径解决。
2. 便于后续维权：如果后续您与培训机构之间发生纠纷，书面协议将成为您维权的重要证据。在诉讼或仲裁过程中，法院或仲裁机构会根据协议的内容来判断双方的权利义务关系，从而做出公正的裁决。如果没有协议，您可能需要花费更多的时间和精力去收集其他证据来证明自己的主张，增加了维权的难度和成本。

特殊情况考虑

如果您确实因为某些特殊原因无法签订协议，建议您至少通过书面形式（如微信、邮件等）与培训机构确认以下内容：

1. 明确剩余学费的金额和退还时间。
2. 确认撤设后双方不再存在其他纠纷。
3. 保留好相关的聊天记录或邮件往来，以备后续需要时作为证据使用。

建议：为了最大程度地保障您的合法权益，避免后续可能出现的纠纷，建议您与培训机构签订书面协议。如果您在签订协议过程中遇到任何问题，或者对协议内容有疑问，都可以随时向我咨询，我会为您提供专业的法律意见。