核心结论：当致人轻伤二级的犯罪嫌疑人死亡时，案件会因犯罪嫌疑人的死亡而终止刑事诉讼程序，但民事赔偿部分仍可由其遗产继承人承担，同时可能涉及行政责任的处理。以下是具体情况的分析：
刑事诉讼程序的终止
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条的规定，犯罪嫌疑人、被告人死亡的，不追究刑事责任，已经追究的，应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理，或者宣告无罪。因此，在犯罪嫌疑人死亡的情况下，针对该犯罪嫌疑人的刑事诉讼程序将终止，不再追究其刑事责任。这意味着，即使犯罪嫌疑人之前的行为构成了犯罪，如致人轻伤二级，也不会再对其进行刑事处罚。
民事赔偿责任的承担
尽管刑事诉讼程序终止，但犯罪嫌疑人的民事赔偿责任并不因此免除。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，因犯罪行为造成他人损害的，应当承担民事赔偿责任。在犯罪嫌疑人死亡的情况下，其民事赔偿责任应由其遗产继承人承担，但以遗产的实际价值为限。这意味着，受害者或其家属仍然有权向犯罪嫌疑人的遗产继承人提出民事赔偿请求，要求赔偿因犯罪行为造成的损失，如医疗费、误工费、残疾赔偿金等。
行政责任的处理
如果犯罪嫌疑人的行为同时违反了行政法规，如治安管理处罚法等，且该行政处罚不以犯罪嫌疑人的刑事责任为前提，那么即使犯罪嫌疑人死亡，相关部门仍可能对其生前行为进行行政处理，如罚款、没收违法所得等。但这种情况相对较少见，且具体处理方式需根据相关法律法规和案件具体情况来确定。