行政事业单位一般不能随意收取与纳税金额有关的违约金，但在特定法律关系下，若符合法定条件，可能存在收取的可能性。以下从不同角度进行分析：

一、行政事业单位的性质与职权

行政事业单位，作为国家机关或公共事业机构，其经费来源主要依靠财政拨款，而非通过市场经营活动获取利润。因此，其职权和职责通常由法律、法规明确规定，不得随意超越或滥用。在税收领域，行政事业单位主要承担税收征收、管理、监督等职责，而非作为税收合同的当事人一方收取违约金。

二、违约金的法律性质

违约金是合同双方约定的，在一方违约时向另一方支付的一定数额的金钱。其目的在于补偿因违约造成的损失，并具有一定的惩罚性。然而，违约金的收取必须基于合法有效的合同关系，且合同内容不得违反法律、行政法规的强制性规定。

三、行政事业单位收取与纳税金额有关违约金的合法性分析

1. 无明确法律依据：

   • 目前，我国法律、行政法规并未明确规定行政事业单位可以收取与纳税金额有关的违约金。税收法律关系主要涉及纳税人、税务机关和税收法律、法规，不涉及违约金条款。

2. 特定法律关系下的可能性：

   • 如果行政事业单位与纳税人之间存在某种特定的法律关系（如政府采购合同、行政协议等），且该合同或协议中明确约定了违约金条款，且该条款不违反法律、行政法规的强制性规定，那么在该特定法律关系下，行政事业单位可能有权收取违约金。但这种情况下的违约金收取与“纳税金额”无直接关联，而是基于合同或协议的约定。

3. 禁止乱收费原则：

   • 行政事业单位必须严格遵守国家关于禁止乱收费的规定。未经法律、行政法规明确授权，不得擅自设立收费项目或提高收费标准。因此，即使行政事业单位认为有必要收取与纳税金额有关的违约金，也必须首先获得法律、行政法规的明确授权。

四、法律建议

1. 对于行政事业单位：

   • 应严格遵守国家法律、行政法规的规定，不得擅自收取与纳税金额有关的违约金。
   • 如需与纳税人建立某种特定的法律关系并约定违约金条款，应确保该条款合法有效，并明确告知纳税人相关权利和义务。

2. 对于纳税人：

   • 如遇到行政事业单位要求收取与纳税金额有关的违约金的情况，应首先核实该要求是否有法律、行政法规的明确依据。
   • 如认为该要求不合法或不合理，可以向相关税务机关或上级主管部门反映情况，并寻求法律帮助。

总结来说，行政事业单位一般不能随意收取与纳税金额有关的违约金。在特定法律关系下，若符合法定条件且合同或协议中有明确约定，可能存在收取的可能性。但无论如何，都必须严格遵守国家法律、行政法规的规定，确保收费行为的合法性和合理性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。