针对您提出的“商品运输车超限超载应有交通执法哪个部门处罚”的问题，我给出以下详细解答：
结论前置：商品运输车超限超载的处罚涉及公安机关交通管理部门和交通运输部门两个主要部门，它们依据各自职责和相关法律法规，共同对超限超载行为进行监管和处罚。
详细分析：
公安机关交通管理部门：
- 职责与处罚依据：根据《中华人民共和国道路交通安全法》，公安机关交通管理部门负责道路交通安全管理工作，对机动车载物是否符合核定的载质量进行严格监管。超载行为违反了该法律的规定，因此公安机关交通管理部门有权进行处罚。
- 处罚方式：对于超载的货车，民警在执勤执法中有权立即进行处罚，包括罚款、记分等。具体罚款金额和记分标准根据超载的严重程度而定，如超载未达30%的，将处以二百元以上五百元以下的罚款，并记3分；超载超过30%或违反规定载客的，则罚款提升至五百元以上二千元以下，并记6分。
交通运输部门：
- 职责与处罚依据：交通运输部门依据《中华人民共和国公路法》和《公路安全保护条例》等法律法规，负责公路运输的监督管理工作，包括对货运车辆是否超限超载进行监管。超限超载运输对公路设施造成损害，因此交通运输部门有权进行处罚。
- 处罚方式：交通运输部门通过设立治超站点、进行称重检测等方式检查货车是否超载。一旦发现超载，会责令当事人采取卸载等措施消除违法状态，并对违法超限运输的货运车辆、货运经营者以及货物装载源头单位进行处罚，如吊销车辆营运证、责令停业整顿等。
总结与建议：
商品运输车超限超载是严重的道路交通违法行为，不仅危害道路交通安全，还可能对公路设施造成严重损害。因此，驾驶员和运输单位应严格遵守相关法律法规，确保货车装载合理、安全行驶。同时，公安机关交通管理部门和交通运输部门也应加强合作与监管，共同打击超载运输行为，维护道路交通秩序和公路安全。
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