一般情况下，仅欠工程款发票这一事实本身不能直接推翻实体判决书，但在特定情形下可能成为再审或上诉等程序中的关键因素之一。以下从不同角度为你详细分析：

从判决生效后的稳定性角度

1. 如果判决书已生效且无其他法定事由
   • 实体判决书是法院根据双方提交的证据、事实认定以及法律规定作出的具有法律效力的裁判文书。一旦生效，就具有既判力，非经法定程序不得随意变更或撤销。
   • 欠工程款发票主要涉及的是财务和税务方面的问题，它本身并不直接否定判决书中所认定的工程款金额、支付义务等核心实体内容。例如，法院在判决中已经依据合同、实际施工情况等证据确定了工程款的数额和支付方，即使支付方没有收到发票，这并不影响法院对工程款支付义务的认定。
2. 如果存在与发票相关的重大事实影响判决结果
   • 影响工程款金额认定：如果发票的缺失导致无法准确核算工程款的实际金额，且在原审中双方对此存在争议，而法院在未充分考虑发票相关因素的情况下作出了判决。那么在后续的再审或上诉程序中，欠发票这一事实可能成为推翻原判决的重要理由。比如，发票上记载的工程内容与合同约定不符，或者发票金额与实际施工量对应的金额存在差异，这可能表明原判决对工程款金额的认定有误。
   • 影响付款条件成就认定：在某些工程合同中，可能会约定以收到发票作为付款的条件之一。如果原审法院没有考虑到这一约定，而直接判决支付工程款，那么在后续程序中，欠发票可能被用来证明付款条件尚未成就，从而推翻原判决中关于立即支付工程款的认定。

从诉讼程序角度

1. 上诉阶段
   • 在上诉期内，如果当事人认为原审判决存在错误，包括与欠工程款发票相关的问题，可以向上一级法院提起上诉。在上诉过程中，当事人可以围绕发票问题提出新的证据和理由，说明原审判决在事实认定或法律适用上存在错误。例如，提供证据证明发票的缺失是由于对方的原因导致的，且这影响了工程款的结算，从而请求上诉法院改判或发回重审。
2. 再审阶段
   • 如果判决书已经生效，当事人认为符合再审条件，可以向法院申请再审。欠工程款发票可能成为再审的事由之一，但需要满足一定的条件。比如，当事人能够证明发票问题是一个新的证据，且该证据足以推翻原判决；或者原判决在认定发票相关事实时存在明显的错误，影响了案件的公正裁判。

实际操作建议

1. 收集证据：如果认为欠工程款发票与案件判决结果有重大关联，要积极收集与发票相关的证据，如合同中关于发票的约定、双方就发票问题的沟通记录、发票缺失的原因证明等。
2. 咨询专业意见：及时向我咨询，我会根据具体的案件情况，包括合同内容、原审判决情况等，为你分析欠工程款发票对判决的影响程度，并制定相应的诉讼策略。
3. 遵循法定程序：如果决定通过上诉或再审等程序来解决问题，要严格按照法律规定的期限和要求提交申请和相关材料，确保程序的合法性和有效性。