在非法吸收公众存款（非吸）个人犯罪案中，若公司被当作犯罪工具，其法律后果及处理方式需结合具体案情综合判断，以下是关键分析：

1. 公司可能被认定为“单位犯罪”共犯或独立犯罪主体

• 若公司决策层直接参与犯罪（如高管授意、组织非吸行为），且犯罪收益归公司所有，公司可能被认定为单位犯罪的共犯，需承担刑事责任。根据《刑法》第176条，单位犯非吸罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员追究刑事责任。
• 若公司完全被个人操控（如实际控制人利用公司名义实施犯罪，公司无独立决策权），公司可能被认定为个人犯罪的工具，此时刑事责任主要由个人承担，但公司可能因“帮助行为”面临行政处罚或民事赔偿。

2. 公司可能面临的法律后果

• 刑事责任：若构成单位犯罪，公司需缴纳罚金，相关责任人（如法定代表人、财务负责人）可能被判处3年以下有期徒刑或拘役，并处或单处罚金；数额巨大或有其他严重情节的，处3-10年有期徒刑，并处罚金。
• 行政处罚：即使不构成犯罪，公司也可能因违反《防范和处置非法集资条例》被监管部门责令整改、罚款，甚至吊销营业执照。
• 民事赔偿：投资者可要求公司返还本金及利息，若公司财产不足以清偿，可能面临破产清算，股东可能需在未出资范围内承担补充赔偿责任。

3. 公司抗辩与辩护方向

• 主张“无犯罪故意”：若公司能证明对非吸行为不知情（如被个人隐瞒利用），且未从中获利，可能免除刑事责任，但需承担管理疏漏的行政责任。
• 区分“个人行为”与“公司行为”：通过财务记录、决策流程等证据，证明非吸行为系个人擅自实施，与公司意志无关，可降低公司责任。
• 积极退赔减责：若公司主动退还投资者资金，可能被认定为“认罪认罚”情节，从而在量刑或处罚上获得从宽处理。

4. 实务建议

• 立即停止非法行为：若公司发现被利用实施非吸，应第一时间终止相关业务，封存资金账户，并向公安机关报案。
• 配合调查与整改：主动配合监管部门调查，提交审计报告、合同等证据，证明公司无主观故意，并制定整改方案。
• 协商退赔方案：与投资者协商退赔比例，争取达成和解，降低民事纠纷风险。

总结：公司被当作非吸犯罪工具时，可能面临刑事、行政、民事三重责任，但具体后果需结合公司参与程度、主观故意等因素综合判断。建议公司尽快委托律师介入，通过证据固定、责任切割等方式最大限度维护权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案情。