诈骗3000元退赃后，案件一般会根据具体情节和司法程序推进，可能涉及行政处罚、刑事立案后撤案或不起诉、或法院从宽处理三种情形。以下是具体分析：

1. 若案件未达到刑事立案标准，可能按治安案件处理
   根据《刑法》及司法解释，诈骗罪的立案标准一般为3000元至1万元以上（各省标准不同）。若3000元未达当地刑事立案标准，公安机关可能按《治安管理处罚法》第49条处理，对行为人处5-15日拘留、500-1000元罚款。此时退赃可能作为从轻情节，但案件仍会以行政处罚结案，需签署《行政处罚决定书》。

2. 若已刑事立案，退赃可能推动撤案或不起诉

   • 侦查阶段撤案：若在公安机关立案后、移送检察院前全额退赃，且行为人认罪态度好、无前科，公安机关可能根据《刑事诉讼法》第16条撤销案件，出具《撤销案件决定书》。
     
   • 检察院不起诉：若案件移送检察院后退赃，检察院可能依据《刑事诉讼法》第177条作出相对不起诉决定（需满足犯罪情节轻微、认罪认罚等条件），此时案件终止于审查起诉阶段。

3. 若已进入审判阶段，退赃可能影响量刑
   若案件已起诉至法院，退赃会作为重要量刑情节。根据《刑法》第266条及司法解释，退赃可减少基准刑的30%以下，结合认罪认罚、初犯等情节，法院可能判处缓刑或单处罚金。例如，诈骗3000元本可能判6个月以下有期徒刑，退赃后可能仅判罚金或缓刑。

关键提醒：

• 退赃需主动联系办案机关（公安机关或检察院），并保留转账记录、谅解书等证据；
  
• 即使退赃，若存在多次诈骗、团伙作案等情节，仍可能被追究刑事责任；
  
• 案件结案后，可要求办案机关出具《结案证明》或《无犯罪记录证明》（若未判刑）。
  

如有具体案件细节（如是否已立案、行为人前科等），可进一步向我咨询，我会结合当地司法实践为您分析。