非法屠宰活动主要由农业农村部门进行管理。以下是对此问题的详细分析：

1. 农业农村部门的职责：

   • 农业农村部门（包括国务院农业农村主管部门及县级以上地方人民政府农业农村主管部门）负责全国范围内或本行政区域内的生猪屠宰活动的监督管理。这包括监督动物屠宰环节的动物防疫工作，确保进入屠宰环节的动物健康无疫病，屠宰后的产品符合质量安全标准。
   • 农业农村部门还指导畜禽屠宰标准化建设和行业发展，包括屠宰企业的设立、布局规划和管理。自2013年起，屠宰监管职能逐渐从商务主管部门划转到畜牧兽医主管部门，这一调整在行政法规中得到了确认，进一步明确了农业农村部门在屠宰管理中的主导地位。

2. 非法屠宰的定义与后果：

   • 非法屠宰通常指的是未经许可或违反相关法律法规进行的屠宰活动。这类活动可能涉及未经检疫的动物、不符合卫生标准的屠宰环境或方法，从而对食品安全和公共卫生构成威胁。
   • 对于非法屠宰行为，农业农村部门有权进行查处，包括责令停止屠宰活动、没收违法所得和屠宰工具等，并可能处以罚款。情节严重的，还可能构成犯罪，依法追究刑事责任。

3. 其他相关部门的协作：

   • 虽然农业农村部门是非法屠宰管理的主要部门，但市场监督管理部门和生态环境部门也在各自职责范围内对屠宰活动进行监管。市场监督管理部门负责检查进入市场销售的肉类产品的来源证明和检验检疫合格证明，查处销售未经检验检疫或检验检疫不合格的肉类产品等违法行为。生态环境部门则对屠宰企业的污染防治工作进行监督管理，确保屠宰过程中产生的污染物达标排放。

法律建议：

• 如果您发现非法屠宰活动，可以向当地的农业农村部门举报，他们将依法进行调查处理。
• 如果您是屠宰行业的从业者，务必确保您的屠宰活动符合相关法律法规的要求，包括获得必要的许可、遵守动物防疫和卫生标准等。
• 如果您对屠宰管理的相关法律法规有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。