结论：继母能否主张权利，取决于款项的性质、转账时间、父亲生前意愿以及是否存在遗嘱或法定继承情形等多种因素。以下从不同角度进行分析：
一、款项性质与转账时间
若款项为父亲个人财产，且转账发生在父亲生前：
- 一般情况下，父亲有权自由处分自己的财产，包括将财产赠与儿子。这种赠与行为在父亲生前完成，且未违反法律法规的强制性规定，是有效的。
- 继母作为父亲的配偶，虽然对父亲的财产享有一定的权益（如夫妻共同财产中的份额），但并不能直接主张父亲赠与儿子的款项归其所有，除非该款项属于夫妻共同财产且未经过继母同意或存在其他法定情形。
若款项为夫妻共同财产，且转账未经继母同意：
- 如果款项属于父亲和继母的夫妻共同财产，父亲在未经继母同意的情况下擅自将款项赠与儿子，可能构成无权处分。
- 继母有权主张该赠与行为部分无效（即属于其份额的部分），并要求儿子返还相应款项。但这一主张需要继母提供充分证据证明款项属于夫妻共同财产，且转账未经其同意。
二、父亲生前意愿与遗嘱
若父亲生前有明确意愿或遗嘱：
- 如果父亲在生前通过遗嘱或其他方式明确表示将款项赠与儿子，且该遗嘱或意愿表示符合法律法规的强制性规定（如遗嘱形式合法、内容真实等），则继母通常无法主张权利。
- 遗嘱是父亲对其财产的最终处分意愿，具有法律效力。继母作为法定继承人之一，除非遗嘱中明确排除了其继承权或对其继承份额有所限制，否则应尊重父亲的遗嘱意愿。
若父亲未留遗嘱，按法定继承处理：
- 如果父亲未留遗嘱，则其遗产（包括可能涉及的款项）应按法定继承处理。
- 在法定继承中，继母作为父亲的配偶，是第一顺序继承人之一，有权继承父亲的遗产。但儿子同样作为第一顺序继承人（如果父亲只有这一个子女或存在其他子女但均未放弃继承权），也有权继承父亲的遗产。
- 此时，继母和儿子应按照法定继承的份额分配父亲的遗产。如果款项已经赠与儿子且无法追回，则可能作为儿子已经继承的遗产部分进行考虑。
三、特殊情况与建议
特殊情况：
- 如果父亲在转账时存在欺诈、胁迫等情形，或者儿子存在恶意侵占、挥霍等行为，继母可能有权主张撤销赠与或要求儿子承担相应责任。
- 如果款项涉及第三方权益（如父亲欠债未还等），则可能涉及债权人的权益保护问题。
建议：
- 继母在主张权利前，应先了解款项的性质、转账时间以及父亲生前的意愿和遗嘱情况。
- 如果认为自己的权益受到侵害，可以收集相关证据（如转账记录、银行流水、遗嘱、证人证言等）并咨询专业律师（即向我咨询）以获取更具体的法律建议。
- 在处理此类纠纷时，应尽量通过协商、调解等和平方式解决，以避免不必要的法律纠纷和家庭矛盾。
总结：继母能否主张权利取决于多种因素，包括款项的性质、转账时间、父亲生前的意愿和遗嘱情况等。在处理此类纠纷时，应综合考虑各种因素并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如果你有进一步的疑问或需要更详细的法律分析，请直接向我咨询。