村委会书记以超面积为由扣留村民宅基地权证的行为，通常是违法的。以下从几个角度进行详细分析：

1. 宅基地权证的法律性质：

   • 宅基地权证是村民依法取得宅基地使用权的法律凭证，受到法律保护。它确认了村民对宅基地的合法使用权，任何单位或个人不得非法剥夺或扣留。

2. 村委会书记的权力范围：

   • 村委会书记作为村委会的负责人，其职责是代表村委会管理村内事务，但并不拥有超越法律的权力。在宅基地管理方面，村委会书记应依法行事，不得擅自扣留村民的宅基地权证。

3. 超面积问题的处理方式：

   • 如果村民的宅基地确实存在超面积的情况，村委会或相关部门应依法进行处理，如要求村民补办相关手续、缴纳超面积使用费或进行整改等。但这些处理方式并不包括扣留宅基地权证。
   • 扣留宅基地权证不仅无法解决超面积问题，反而可能侵犯村民的合法权益，引发不必要的纠纷和矛盾。

4. 法律后果与维权途径：

   • 如果村委会书记擅自扣留村民的宅基地权证，村民有权向相关部门投诉或寻求法律援助。根据法律规定，侵犯公民合法财产权益的行为应承担相应的法律责任。
   • 村民可以通过行政复议、行政诉讼等途径维护自己的合法权益，要求村委会书记返还宅基地权证并赔偿因此造成的损失。

建议：

• 如果你作为村民遇到了这种情况，首先应与村委会书记进行沟通，了解其扣留宅基地权证的具体原因和依据。
• 如果沟通无果，你可以向乡镇政府或相关部门反映情况，寻求帮助和支持。
• 同时，你也可以咨询专业律师，了解自己的法律权益和维权途径，以便更好地维护自己的合法权益。

在处理此类问题时，请务必保持冷静和理性，依法行事，避免采取过激行为或言语冲突。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。