结论：合同期未满连续更换三次主体是否合法，不能一概而论，需根据具体情况判断，包括更换主体的原因、方式以及是否遵循了相关法律法规和合同约定等。以下从不同角度进行分析：
一、合法情形
合同约定允许：
- 如果原合同中明确约定了合同主体可以变更，且变更的条件、程序等均已明确，那么在满足这些条件的情况下，连续更换三次主体是合法的。
- 例如，合同中可能规定，在特定情况下（如一方股东变更、业务重组等），合同主体可以变更为新的实体，且这种变更不影响合同的继续履行。
双方协商一致：
- 即使原合同中没有明确约定主体可以变更，但如果双方通过协商一致，同意变更合同主体，并且这种变更不违反法律法规的强制性规定，那么也是合法的。
- 在这种情况下，双方应当签订书面协议，明确变更后的权利义务关系，以确保合同的连续性和稳定性。
法定情形：
- 在某些特定情况下，法律可能允许合同主体的变更。例如，在企业合并、分立等情形下，根据相关法律法规的规定，合同权利义务可能由合并后的企业或分立后的企业承继。
二、不合法情形
违反法律法规强制性规定：
- 如果合同主体的变更违反了法律法规的强制性规定，如未经批准擅自变更合同主体、变更后的主体不具备相应的资质或条件等，那么这种变更是违法的。
- 例如，在某些特定行业（如金融、医疗等），合同主体的变更可能需要经过相关监管部门的批准或备案，如果未经批准擅自变更，就可能构成违法。
损害第三方利益：
- 如果合同主体的变更损害了第三方的利益，如债权人、债务人等，且这种损害没有得到第三方的同意或补偿，那么这种变更也可能被视为违法。
- 例如，在债权转让中，如果未经债务人同意擅自将债权转让给第三方，且这种转让对债务人造成了不利影响，那么债务人可以主张这种转让无效。
恶意串通损害国家、集体或他人利益：
- 如果合同主体的变更是双方恶意串通的结果，且这种变更损害了国家、集体或他人的利益，那么这种变更也是违法的。
- 例如，双方为了逃避税收、规避法律责任等目的而恶意变更合同主体，就可能构成违法。
三、法律建议
审查合同条款：
- 在面临合同主体变更时，首先应当审查原合同中的相关条款，了解是否允许变更以及变更的条件和程序等。
协商一致并签订书面协议：
- 如果双方同意变更合同主体，应当签订书面协议，明确变更后的权利义务关系、变更的时间、方式等关键条款。
遵守法律法规：
- 在变更合同主体时，必须遵守相关法律法规的强制性规定，确保变更的合法性和有效性。
考虑第三方利益：
- 如果变更合同主体可能涉及第三方的利益，应当事先与第三方进行沟通并取得其同意或补偿，以避免引发不必要的法律纠纷。
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