作为有丰富经验的律师，针对你“追尾货柜车，定损理赔后被起诉追责停运损失如何应诉”这一问题，核心结论是你可以从多个方面积极准备应诉，以下为你详细阐述：
- 审查对方诉求的合理性
- 停运损失的计算依据：要求对方提供详细的停运损失计算方式和相关证据。比如，货柜车在停运期间的每日运营成本，包括司机工资、车辆折旧、燃油费、过路费等，以及因停运导致的预期收入减少的证明，如运输合同、以往的运营收入记录等。如果对方无法提供充分合理的证据来支持其停运损失的计算金额，你可以主张其诉求缺乏事实依据。
- 停运时间的合理性：核实对方主张的停运时间是否合理。例如，货柜车在事故后的维修时间是否过长，是否存在故意拖延维修以获取更多停运损失赔偿的情况。你可以要求对方提供维修厂的维修记录、维修进度说明等证据，以证明停运时间的真实性。如果发现对方存在不合理延长停运时间的行为，你可以在应诉中提出异议，要求法院对合理的停运时间进行认定。
- 分析事故责任与停运损失的因果关系
- 自身责任程度：回顾事故发生时的具体情况，确定自己在事故中所承担的责任比例。如果事故责任并非完全由你承担，那么对方主张的停运损失也应按照责任比例进行分担。例如，如果事故认定你承担70%的责任，那么对方只能就其停运损失的70%向你主张赔偿。
- 停运损失与事故的直接关联性：确认对方的停运损失是否确实由本次追尾事故直接导致。有些情况下，货柜车可能本身存在其他故障或问题，导致即使没有本次事故也会停运维修。你可以通过调查了解货柜车的维修历史、车辆状况等信息，来质疑对方停运损失与事故之间的直接因果关系。如果能够证明对方的停运损失并非完全由本次事故造成，你可以要求法院减少或免除相应的赔偿责任。
- 准备相关证据进行抗辩
- 事故现场证据：收集事故现场的照片、视频、交警出具的事故认定书等证据，以证明事故发生的事实和责任划分情况。这些证据可以帮助你在应诉中明确自己的责任范围，为抗辩对方的停运损失诉求提供依据。
- 沟通记录：保留与对方在事故发生后的沟通记录，如短信、微信聊天记录、通话录音等。如果对方在沟通过程中承认了某些不利于其主张停运损失的事实，如承认车辆本身存在问题、维修时间过长等，这些记录可以作为有力的抗辩证据。
- 维修情况证据：如果可能的话，了解货柜车的维修情况，包括维修厂的资质、维修工艺、更换的零部件等。如果发现维修过程中存在不合理的情况，如使用了不必要的昂贵零部件、维修工艺不当导致维修时间延长等，你可以收集相关证据并在应诉中提出，以质疑对方停运损失的合理性。
- 考虑诉讼时效和程序问题
- 诉讼时效：确认对方起诉是否在诉讼时效期间内。根据相关法律规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间一般为三年。如果对方起诉时已经超过诉讼时效，你可以在应诉中提出诉讼时效抗辩，要求法院驳回对方的诉讼请求。
- 程序合法性：审查对方的起诉程序是否合法，如是否按照法定程序送达起诉状、是否在规定的期限内提交证据等。如果发现对方存在程序违法的情况，你可以向法院提出异议，要求法院依法处理，这可能会对案件的审理产生一定的影响。
在应诉过程中，建议你及时委托专业律师协助你处理案件。律师可以根据具体情况为你制定详细的应诉策略，收集和整理相关证据，代表你参加庭审，维护你的合法权益。如果你还有其他关于交通事故赔偿、应诉等方面的法律问题，欢迎随时向我咨询。