在建设工程领域，结算工程时扣除水电费的法律依据主要来源于合同约定以及相关法律法规的规定。以下从这两个方面为你详细分析：
一、合同约定
在建设工程合同中，双方通常会就工程款的支付、结算方式以及各项费用的承担等事项进行明确约定。如果合同中明确规定了水电费由哪一方承担，或者规定了水电费在结算工程款时予以扣除，那么这一约定就具有法律效力，双方应当按照合同约定执行。
具体情形：
合同明确约定水电费由承包方承担：在这种情况下，发包方在结算工程款时，有权根据合同约定扣除承包方应承担的水电费。
合同明确约定水电费在结算时扣除：即使合同没有明确指出水电费由哪一方承担，但如果约定了水电费在结算工程款时予以扣除，那么发包方同样有权进行扣除。
二、相关法律法规
虽然直接针对结算工程扣除水电费的法律法规可能并不多见，但我们可以从相关法律法规的原则和精神中推导出相应的法律依据。
《中华人民共和国民法典》合同编：该法规定了合同的基本原则和履行规则，包括当事人应当按照约定全面履行自己的义务等。在建设工程合同中，如果双方就水电费的承担或扣除有明确约定，那么这一约定就受到法律的保护。
行业惯例和交易习惯：在建设工程领域，扣除水电费作为一种常见的做法，往往被视为行业惯例或交易习惯。如果合同中没有明确约定，但双方在实际履行过程中均按照这一惯例或习惯进行操作，那么也可以视为双方对水电费扣除的默认同意。不过，需要注意的是，行业惯例和交易习惯并不能完全替代合同约定，它们通常只在合同没有明确规定或规定不明确时起到补充作用。
法律建议
审查合同条款：在结算工程款前，双方应仔细审查合同条款，特别是关于水电费承担和扣除的约定。如果合同中有明确规定，那么应按照合同约定执行。
协商解决争议：如果合同中没有明确约定或约定不明确，双方应通过协商解决争议。在协商过程中，可以参考行业惯例和交易习惯，以及双方的实际履行情况等因素进行综合考虑。
寻求法律途径：如果双方无法通过协商解决争议，那么可以寻求法律途径解决。在这种情况下，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。
总结来说，结算工程时扣除水电费的法律依据主要来源于合同约定以及相关法律法规的规定和行业惯例。在实际操作中，双方应仔细审查合同条款并遵循相关法律法规和行业惯例进行操作。如果有任何疑问或争议，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。