核心结论：在工程收款公司账号被封的情况下，可通过以下两种合法途径收款并开具发票：一是申请解封账号后正常操作；二是通过其他合法账户代收款项并合规开具发票。以下为详细说明：

1. 申请解封账号后正常收款与开票

   • 解封流程：首先，需要明确账号被封的具体原因，这通常涉及与银行、税务或司法机关的沟通。根据封号原因，准备相应的证明材料，如税务合规证明、法院解封裁定等，向相关部门提交解封申请。
   • 收款与开票：一旦账号解封，即可恢复正常收款流程，并按照税务规定开具相应的发票。确保所有交易记录清晰、完整，以备税务稽查。

2. 通过其他合法账户代收款项并合规开具发票

   • 代收账户选择：若账号短期内无法解封，可考虑通过公司的其他合法账户（如备用账户、关联公司账户等）代收款项。需确保代收账户与交易双方存在合法的业务关系，且代收行为符合相关法律法规。
   • 合规开票：代收款项后，应由实际提供服务或销售商品的公司（即原被封账号的公司）开具发票。若代收方与开票方不一致，需在发票上注明代收情况，并确保所有交易链条清晰、可追溯。
   • 税务处理：代收款项可能涉及税务问题，如代收手续费、增值税等。需根据税法规定，合理计算并缴纳相关税费，避免税务风险。

额外建议：

• 加强内部管理：账号被封往往与内部管理不善有关，如税务违规、资金异常流动等。因此，建议加强公司内部管理，确保所有交易合法合规，避免类似情况再次发生。
• 咨询专业机构：在处理此类复杂问题时，可咨询专业的会计师事务所或税务师事务所，以获取更具体、更专业的指导。
• 保持沟通：与银行、税务机关等保持密切沟通，及时了解账号解封进展和税务政策变化，确保公司运营不受影响。