事业单位职工病假扣工资是否违法，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下是对此问题的全面分析：
一、合法扣减工资的情形
依据合法有效的内部规定：
- 如果事业单位有合法有效的规章制度或劳动合同中明确规定了病假期间工资的扣减方式，并且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么单位按照这些规定扣减工资是合法的。例如，单位可能规定病假期间扣发部分或全部的津贴、补贴和奖金，但基本工资（如岗位工资、薪级工资）可能不受影响或受影响较小。
符合病假工资发放标准：
- 根据《国家机关工作人员病假期间生活待遇的规定》及相关政策，事业单位职工病假在两个月以内的，原工资照发（基本工资部分），但单位可能根据内部规定扣发部分或全部的津贴、补贴和奖金。病假超过两个月后，工资发放标准会根据工作年限和病假时长有所调整，但通常也不会低于当地最低工资标准的80%。如果单位扣减工资后，员工实际收入仍不低于此标准，则扣减行为可能合法。
绩效工资与工作业绩挂钩：
- 绩效工资是基于员工绩效考核结果而发放的工资组成部分。如果员工请病假导致工作完成情况和工作业绩受影响，且绩效工资的评定是基于实际工作成果、工作任务完成度等指标，那么单位扣减病假期间的绩效工资可能具有合理性。但扣减幅度应合理，不得超出病假对工作业绩影响的合理范围。
二、违法扣减工资的情形
无规定或规定不合法：
- 如果事业单位没有关于病假扣减工资的明确规定，或者规定本身不合理、不合法（如违反《劳动法》等），那么单位不能随意扣减员工的工资。例如，单位不能仅因员工请病假就扣减其全部工资或基本工资部分。
违反法律底线：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。如果单位没有合理依据扣减工资，即构成克扣工资的违法行为。此外，如果单位扣减工资后导致员工实际收入低于当地最低工资标准的80%，则同样可能违法。
违反劳动合同约定：
- 如果事业单位与员工签订的劳动合同中明确约定了病假期间工资的发放方式（如不扣减或按一定固定比例发放），而单位违反该约定进行扣减，则属于违法行为。
三、员工权益保护与建议
- 了解单位规定：员工在入职时应仔细阅读单位的规章制度和劳动合同，了解病假期间工资的发放标准和方式。
- 保留证据：如果员工认为单位扣减工资的行为违法，应保留好相关证据，如工资条、请假条、医疗证明等。
- 沟通协商：员工可以与单位进行沟通协商，要求单位说明扣减依据和理由，并尝试达成和解。
- 投诉或仲裁：如果协商不成，员工可以向当地劳动监察部门投诉或依法申请劳动人事争议仲裁来维护自己的合法权益。
总结来说，事业单位职工病假扣工资是否违法，关键在于单位是否有合法有效的内部规定、扣减是否合理以及是否符合劳动合同约定。员工应了解自己的权益和单位的义务，并在必要时采取法律手段维护自身权益。如果你对此问题仍有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。