面对已转账还款但未拿回借条，又被对方起诉的情况，你可以通过以下措施来维护自己的合法权益：
全面收集还款证据：
- 银行转账记录：这是最直接且有力的证据。务必保留好转账凭证及银行流水明细，这些能清晰显示转账的时间、金额、账户信息等，是证明你已还款的关键。
- 聊天记录或通话录音：如果与对方在还款前后有微信、短信聊天或电话录音，其中包含对方承认收到还款的内容，这些也可以作为辅助证据。
- 证人证言：如果还款时有第三人在场，可以请其作为证人出庭作证，证明你已还款的事实。
积极应诉，准备答辩：
- 仔细阅读起诉状：了解对方的诉求和依据，明确争议点，这是制定应诉策略的基础。
- 撰写并提交答辩状：在规定时间内向法院提交答辩状，详细陈述你已经还款的事实，并附上相关证据材料，反驳对方的主张。
- 按时参加庭审：遵守法庭纪律，尊重法官和其他诉讼参与人。在庭审中，清晰陈述还款经过，出示证据，接受质证。
- 进行法庭辩论：针对对方的观点和证据进行有理有据的反驳，强调自己已履行还款义务。
要求对方提供借条原件：
- 在诉讼过程中，你可以要求对方提供借条原件进行核对。如果对方无法提供或原件存在瑕疵（如涂改、模糊等），这将影响其诉求的成立。
关注诉讼时效问题：
- 根据法律规定，注明还款日期的借条，诉讼时效从到期之日起三年内；未注明还款日期的借条，从第一次追讨之日起三年内有效。如果对方提起诉讼已超过了法定的诉讼时效期间，你可以提出时效抗辩，对方可能会因此丧失胜诉权。
保持冷静与配合：
- 面对诉讼，保持冷静和理智至关重要。避免因情绪激动而做出不利于自己的言行。同时，要积极配合法院的调查和审理工作，按时提交所需材料。
可能面临的法律后果及应对建议：
- 如果证据充分，法院可能驳回对方诉求：如果你能提供充分的还款证据，且对方无法提供有效的借条原件或存在其他瑕疵，法院可能会驳回对方的诉讼请求，认定你已履行还款义务。
- 如果证据不足，可能面临败诉风险：如果你无法提供足够的还款证据，或者证据存在瑕疵，法院可能会支持对方的诉求，要求你再次还款。因此，务必重视证据的收集和保存。
- 和解或调解的可能性：在诉讼过程中，你也可以考虑与对方进行和解或调解。通过协商达成一个双方都能接受的解决方案，可能是一个更为高效和经济的方式来解决此问题。
示例说明：
假设你通过银行转账向对方还款，并保留了转账凭证和银行流水明细。在庭审中，你可以向法官展示这些证据，并陈述还款经过。如果对方无法提供有效的借条原件或存在其他瑕疵，法院很可能会认定你已履行还款义务，驳回对方的诉讼请求。
总结与建议：
面对此类情况，关键在于通过收集充分的还款证据并积极应诉来维护自己的合法权益。同时，也要关注诉讼时效问题，确保在法定期限内提起诉讼或应诉。如果你对法律程序不熟悉或担心自己无法有效应对诉讼程序，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。