结论：若您已通过转账方式还清借款，但借条未收回，对方仍起诉您，只要您能提供充分证据证明已还款，法院通常不会支持对方的诉求。

分析如下：

1. 证据收集是关键：

   • 转账记录：您应保存好转账的流水明细、电子回单等，这些记录需能清晰显示转账的金额、时间以及双方账号信息，以证明您已履行还款义务。
   • 其他证据：若还款时有其他人在场，可请其作为证人出庭作证；若有与对方关于还款事宜的聊天记录、通话录音等，也应妥善保存，这些均可作为辅助证据。

2. 应诉流程：

   • 按时参加诉讼：收到法院传票后，您应按规定时间和地点参加庭审。
   • 出示证据并陈述事实：在庭审中，您应清晰、准确地向法官陈述已还款的事实经过，并出示收集到的证据。
   • 反驳对方主张：针对对方的主张，您应合理反驳，指出借条虽未收回，但已有充分证据证明债务已清偿。

3. 法律后果：

   • 若证据充分：根据《民法典》的相关规定，债务清偿后债权债务关系消灭。因此，若您能提供充分证据证明已还款，法院通常会驳回对方的诉讼请求。
   • 若证据不足：若您无法提供充分证据证明已还款，则可能面临不利判决，即法院可能支持对方的诉求，要求您再次还款。

4. 特殊情况处理：

   • 若对欠条真实性存疑：若您认为欠条可能存在伪造等情况，可向法院申请笔迹鉴定，以确定欠条的真实性。
   • 若对方主张欠条未收回有其他原因：在庭审中，若对方主张欠条未收回有其他原因（如您未完全还款等），则应让其举证，您可针对其主张进行合理反驳。

建议与提醒：

• 还款时最好让对方出具收条：为避免类似纠纷，建议您在还款时让对方出具收条，并注明欠条作废，这样可更有效地证明债务已清偿。
• 保留好所有相关证据：即使还款时拿回了欠条，其他能证明还款事实的证据（如转账记录、聊天记录等）也不应随意删除，以备不时之需。
• 及时咨询专业律师：若您在应诉过程中遇到任何法律问题或困惑，可及时向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。