村长开果袋厂并邀请村民入股的行为是否合法，需分情况讨论，关键在于是否符合相关法律规定并履行必要程序。具体分析如下：

1. 主体资格合法性
   村长作为村集体经济组织负责人或村民委员会成员，其个人投资开办企业（如果袋厂为个人独资或合伙企业）属于民事行为，法律未禁止公职人员经商，但需满足两个条件：

   • 未利用职务便利为工厂谋取不正当利益；
     
   • 未违反《公务员法》或地方对村干部的兼职限制（如部分地区规定村干部不得兼任企业负责人）。
     若村长以个人名义开厂，且资金来源合法，主体资格通常无问题。

2. 入股行为合法性
   入股的合法性取决于工厂性质及操作方式：

   • 若工厂为村集体企业：需经村民会议或村民代表会议讨论决定，并符合《村民委员会组织法》关于集体资产处置的程序要求（如公开招标、公示等）。
     
   • 若工厂为个人企业：村长邀请村民入股属于民事合伙或股权合作，需签订书面协议明确权利义务（如出资方式、分红比例、退出机制等），并避免构成非法集资。
     非法集资风险点：若以高息回报为诱饵、向不特定对象吸收资金、未用于生产经营，可能涉嫌《刑法》第176条非法吸收公众存款罪。

3. 利益冲突与职务回避
   村长作为管理者，需避免以下情形：

   • 利用职务便利为工厂优先获取村集体资源（如土地、补贴）；
     
   • 在工厂与村集体交易中谋取私利（如低价承包村集体果园）；
     
   • 未披露个人与工厂的利益关联，损害村民知情权。
     若存在上述行为，可能构成职务侵占或违反廉洁纪律。

建议操作步骤：

1. 明确工厂性质（个人/集体），若为集体企业需履行民主程序；
   
2. 签订书面入股协议，建议由律师审核条款；
   
3. 村长公开个人与工厂的利益关系，接受村民监督；
   
4. 避免向非本村村民或超过法定人数吸收资金。
   

如有具体操作细节或纠纷，可进一步向我说明情况，我会结合事实为您分析法律风险。