政府部门聘用专业机构，在多数情况下是适用《政府采购法》的，但具体还需根据采购的性质、金额以及专业机构的类型等因素来综合判断。以下从不同角度进行分析：

1. 适用《政府采购法》的一般情况：

   • 采购性质：如果政府部门聘用专业机构是为了提供公共服务或进行公共管理，且这种服务或管理具有公共属性，如法律咨询、审计、评估等，那么这种采购行为通常被视为政府采购，适用《政府采购法》。
   • 采购金额：根据《政府采购法》的规定，政府采购的限额标准由省级以上人民政府规定。如果聘用专业机构的费用达到或超过这一限额标准，那么就必须按照《政府采购法》的规定进行采购。
   • 采购方式：政府部门在聘用专业机构时，如果采用了公开招标、邀请招标、竞争性谈判、单一来源采购或询价等《政府采购法》规定的采购方式，那么这种采购行为显然适用《政府采购法》。

2. 可能不适用《政府采购法》的例外情况：

   • 特定项目或紧急情况：在某些特定项目或紧急情况下，如自然灾害救援、突发事件处理等，政府部门可能需要迅速聘用专业机构以应对紧急状况。在这种情况下，如果严格按照《政府采购法》的规定进行采购可能会延误时机，因此可能不适用《政府采购法》。但这种情况通常会有相应的法律法规或政策文件进行特殊规定。
   • 专业机构性质：如果聘用的专业机构属于政府部门内部机构或具有特殊性质（如某些科研机构、高校等），且其提供服务的方式、费用结算等与常规的政府采购有显著差异，那么可能不适用《政府采购法》。但这种情况也需要根据具体法律法规和政策文件来判断。

3. 法律建议：

   • 明确采购性质：政府部门在聘用专业机构前，应首先明确采购的性质、目的和金额，以判断是否适用《政府采购法》。
   • 遵循采购程序：如果适用《政府采购法》，政府部门应严格按照法律规定的采购程序进行操作，确保采购的公开、公平、公正和透明。
   • 咨询专业意见：对于复杂或特殊的采购项目，政府部门可以咨询专业律师或政府采购专家的意见，以确保采购行为的合法性和合规性。

总结来说，政府部门聘用专业机构是否适用《政府采购法》取决于多种因素，包括采购的性质、金额、方式以及专业机构的类型等。在大多数情况下，这种采购行为是适用《政府采购法》的。但为了确保采购的合法性和合规性，政府部门在聘用专业机构前应进行充分的评估和咨询。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。