在合同被改且没有直接证据的情况下，确实会面临一定的法律困境，但并非完全无法应对。以下是从不同角度为你提供的分析和建议：

1. 尝试收集间接证据：

   • 沟通记录：检查是否有与合同修改相关的邮件、短信、微信聊天记录等。这些记录可能间接证明合同被修改的事实或双方对修改内容的讨论。
   • 证人证言：如果有目击者或了解合同修改情况的第三方，他们的证言可能作为间接证据使用。
   • 履行情况：分析合同履行过程中的实际情况，如付款记录、交货单等，这些可能反映合同实际执行的内容与原始合同或修改后的合同之间的差异。

2. 利用法律原则进行抗辩：

   • 公平原则：如果合同修改显著不利于一方，且该方在修改时并未同意或不知情，可以依据公平原则主张修改无效。
   • 诚实信用原则：如果对方在合同修改过程中存在欺诈、胁迫等不诚信行为，可以依据诚实信用原则主张修改无效或撤销合同。

3. 考虑合同修改的形式要求：

   • 书面形式：根据《民法典》的相关规定，某些类型的合同修改必须采用书面形式。如果合同修改未采用书面形式，且法律有明确规定，可以主张修改无效。
   • 签字或盖章：检查合同修改部分是否有双方的签字或盖章。如果没有，可以质疑修改的真实性和有效性。

4. 寻求专业鉴定：

   • 笔迹鉴定：如果合同修改部分涉及手写内容，且怀疑是伪造或篡改的，可以考虑进行笔迹鉴定。
   • 文件形成时间鉴定：在某些情况下，可以通过鉴定确定合同修改部分的形成时间，从而判断其真实性。

5. 法律程序与策略：

   • 协商与调解：在证据不足的情况下，首先尝试与对方进行协商或调解，寻求双方都能接受的解决方案。
   • 提起诉讼或仲裁：如果协商无果，可以考虑提起诉讼或仲裁。在诉讼或仲裁过程中，充分利用上述间接证据和法律原则进行抗辩。
   • 申请法院调查取证：在特定情况下，可以向法院申请调查取证，要求法院协助收集与合同修改相关的证据。

行动建议：

• 立即停止履行可疑合同条款：在确认合同被非法修改前，避免继续履行可能对自己不利的条款。
• 咨询专业律师：由于合同纠纷涉及复杂的法律问题和证据规则，建议尽快咨询专业律师，以便制定更具体的应对策略。
• 保留所有相关证据：无论证据是否直接，都应妥善保留，以备不时之需。

最后需要强调的是，每个合同纠纷案件都有其独特性，因此上述建议并不能替代具体案件中的法律分析和策略制定。如果你面临合同被改且没有证据的情况，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。