结论前置：项目经理有在建项目，主要可能违反的是招标文件中关于项目经理任职资格的特定要求，而非直接违反《中华人民共和国招标投标法》的某一条具体法条。不过，若因项目经理有在建项目导致中标后无法履行合同，则可能间接违反《中华人民共和国招标投标法》中关于中标人应履行合同义务的相关规定。
一、招标文件中的特定要求
项目经理任职资格：
- 在许多招标项目中，招标文件会明确规定拟派项目经理在投标时不得有在建项目。这一要求旨在确保项目经理能够全身心投入到新项目中，保证项目的顺利进行。
- 如果项目经理在投标时有在建项目，且未按照招标文件要求披露或获得招标人特别许可，那么该投标可能被视为不符合招标文件要求，从而导致投标无效或中标后被取消资格。
违反后果：
- 若违反招标文件中的这一规定，招标人有权根据招标文件及法律法规取消中标资格，没收投标保证金，并可能依法追究投标人的法律责任。
二、《中华人民共和国招标投标法》的相关规定
中标人的义务：
- 根据《中华人民共和国招标投标法》第四十六条，中标人应当按照合同约定履行义务，完成中标项目。如果项目经理因有在建项目而无法履行合同，中标人则构成违约。
法律责任：
- 若中标人因项目经理有在建项目而无法履行合同，招标人除有权取消中标资格外，还可要求中标人承担违约责任，包括赔偿损失等。
- 在某些情况下，如果中标人的行为构成欺诈或恶意串通，还可能面临更严重的法律后果，如被列入不良行为记录名单、限制参与招投标活动等。
三、实际操作中的建议
投标前核查：
- 投标人在投标前应仔细核查拟派项目经理的任职资格，确保其没有在建项目或已获得相关项目的业主同意可以同时承担新项目。
与招标人沟通：
- 如果项目经理确实有在建项目，但认为不会影响新项目的实施，投标人应提前与招标人沟通，说明情况并获得招标人的书面同意。
合同审查与风险防控：
- 中标后，中标人应仔细审查合同条款，特别是关于项目经理的任职资格、职责及违约责任等条款，确保自身能够履行合同义务。
- 同时，中标人应制定风险防控措施，如增加项目管理团队关键人员、加强项目进度和质量监控等，以降低因项目经理有在建项目而带来的风险。
四、具体案例与法律适用
- 在实际案例中，如果招标人发现中标项目经理有在建项目且未按照招标文件要求披露，招标人通常会依据招标文件及《中华人民共和国招标投标法》的相关规定取消中标资格，并可能依法追究投标人的法律责任。
- 如果中标人能够证明项目经理的在建项目不会对新项目的实施产生实质性影响，并且获得了招标人的书面同意，那么该情况可能不构成违约或违法。
五、总结与提醒
- 项目经理有在建项目主要违反的是招标文件中的特定要求，而非直接违反《中华人民共和国招标投标法》的某一条具体法条。但这一行为可能导致中标后无法履行合同，从而间接违反相关法律法规。
- 投标人在投标前应仔细核查项目经理的任职资格，确保符合招标文件要求；中标后应严格履行合同义务，加强风险防控措施。
- 如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。