结论：情节显著轻微、危害不大且不认为是犯罪的行为，一般不会留下案底。但具体是否留有案底，还需结合司法机关的处理结果及法律规定来综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、情节显著轻微、危害不大的法律认定
根据《中华人民共和国刑法》第十三条的规定，虽然某些行为可能形式上符合犯罪构成要件，但如果这些行为“情节显著轻微且危害不大”，则不被认定为犯罪。这一原则体现了刑法的谦抑性，旨在避免对轻微行为进行过度刑事化处理，从而合理界定犯罪的范围。
二、可能不留案底的情况
检察院不起诉：
- 法定不起诉：根据《刑事诉讼法》第十六条，对于情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的等情况，人民检察院应当作出不起诉决定。此时，由于行为未被认定为犯罪，因此不会留下案底。
- 酌定不起诉：对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。这种情况下，一般也不会留下案底。
- 附条件不起诉：特别针对未成年人，若符合一定条件，人民检察院可以作出附条件不起诉的决定。考验期满后，若遵守相关规定，检察院将作出不起诉决定，通常也不会留下案底。
未成年人犯罪记录封存：
- 对于未成年人犯罪，若符合封存条件，其犯罪记录将被封存。非法定情形不得向任何单位和个人提供，这实际上起到了“无案底”的效果。
三、可能留下案底的情况
法院有罪判决：
- 若法院最终认定构成犯罪，即使情节轻微，也会判处相应的刑罚（如管制、拘役、有期徒刑等），并留下案底。这种情况下，案底将成为个人犯罪历史的记录，可能对个人的生活、工作等方面产生一定影响。
特定不起诉情形的记录：
- 需要注意的是，某些特定不起诉情形（如因犯罪情节轻微而被不起诉）仍可能会有案底记载。但具体影响需根据相关部门的规定和实际情况来判断。例如，某些单位在招聘时可能要求提供无犯罪记录证明，而特定不起诉情形可能不在此列，但具体还需根据相关规定来确定。
四、建议与注意事项
增强法律意识：
- 无论是否会留下案底，个人都应增强法律意识，遵守法律法规，避免触碰法律红线。轻微违法行为也可能对个人和社会造成不良影响，因此应时刻保持警惕。
及时咨询专业律师：
- 面对涉及犯罪的问题，建议及时向我咨询以获取最准确的法律意见和帮助。我可以根据具体情况提供针对性的法律建议，帮助你更好地维护自己的合法权益。
了解案底的影响与查询：
- 案底记录严格管理，非经法定程序不得公开。通常仅供司法机关及相关单位合法查询，并确保严格保密。但案底仍可能对个人的生活、工作等方面产生一定影响，因此应了解其影响范围并做好相应准备。
综上所述，情节显著轻微、危害不大且不认为是犯罪的行为一般不会留下案底。但具体是否留有案底还需结合司法机关的处理结果及法律规定来综合判断。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。