机关单位合同工的劳动合同是否入档案，需分情况讨论：

1. 人事档案角度
   根据《干部档案工作条例》及《企业职工档案管理工作规定》，劳动合同本身通常不直接归入个人人事档案。但以下材料会存入档案：
   
   • 录用手续（如机关单位出具的录用通知、审批表）
     
   • 岗位聘任文件（如编制外人员聘任书）
     
   • 工资变动记录（反映劳动关系存续期间的经济待遇）
     
   • 考核材料（年度考核表等）
     
   • 解除/终止劳动关系证明（如离职文件、退休审批表）
     

特殊情形：若合同工通过公开招考进入机关单位（即使无编制），其招考报名表、体检表等前期材料会归入档案。

1. 劳动合同管理角度
   机关单位需按《劳动合同法》保存劳动合同文本至少2年备查，但保存方式包括：

   • 集中存放于单位人事部门档案室（非个人人事档案）
     
   • 电子化扫描存档（需符合《电子签名法》要求）
     
   • 特殊岗位（如涉密岗位）可能要求劳动合同副本随工作资料移交
     

2. 实务建议

   • 合同工可主动要求单位出具《劳动关系证明》，作为履历佐证材料
     
   • 若涉及社保转移、职称评定等事项，需确认档案中是否包含关键材料
     
   • 离职时建议索取劳动合同解除证明，并核对档案转递手续
     

温馨提示：不同地区机关单位档案管理存在差异，建议结合本单位《档案管理制度》进一步核实。如有具体操作疑问，可向我补充说明单位性质、岗位类型等信息后深入解答。