面对员工不配合走工伤认定流程的情况，公司可以采取以下措施来应对：

一、核心结论

公司应首先尝试通过积极沟通消除员工顾虑，并明确告知其工伤认定的意义和流程。若沟通无效，公司可保留相关证据，并在规定时间内自行向劳动保障行政部门提交工伤认定申请。在必要时，可寻求法律途径解决争议，确保行为合法合规。

二、详细措施

1. 积极沟通解释

   • 与员工及其家属进行友好沟通，详细了解其不配合的具体原因。
   • 清晰解释工伤认定的必要性、流程以及对员工权益的全方位保障，如医疗费用报销、停工留薪期待遇等。
   • 承诺在工伤认定过程中，公司会全力保护员工的合法权益，避免任何不利处理。

2. 提供政策指导与协助

   • 向员工提供《工伤保险条例》等相关法律法规的详细解读，或邀请专业人士进行政策宣讲。
   • 如员工因手续复杂或材料准备困难而犹豫，公司应安排专人协助准备申请材料，并指导其完成各项手续。

3. 保留证据并自行申请

   • 在与员工沟通、协助的过程中，注意保留好所有相关的证据材料，如聊天记录、书面通知、会议纪要以及员工拒绝配合的书面声明等。
   • 若员工仍坚持不配合，公司应在事故伤害发生之日或被诊断为职业病之日起30日内（特殊情况可适当延长），自行向劳动保障行政部门提交工伤认定申请，并提交充分的申请材料。

4. 寻求第三方调解与法律途径

   • 若直接沟通效果不佳，可考虑引入劳动争议调解组织、工会等中立第三方机构进行调解。
   • 在极端情况下，如员工的不配合行为严重影响了工伤认定的进程，公司可向工伤认定机构书面说明情况，请求其依职权调查核实。必要时，依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。

5. 注意法律程序与合规性

   • 在整个处理过程中，公司必须严格遵循《工伤保险条例》及其他相关法律法规的规定，确保所有行为合法合规。
   • 公司应积极维护自身及员工的合法权益，避免因程序不当或沟通不畅而引发不必要的法律纠纷。

三、特殊情况考虑

• 对于员工可能存在的特殊情况，如误解、担心鉴定结果不利或心理抵触等，公司应给予充分的理解和支持，并提供针对性的解决方案。
• 如果员工的不配合是由于公司的不当行为或管理问题导致的，公司应首先进行自我反省和整改，以重建员工的信任，并积极配合员工进行工伤认定。

综上所述，面对员工不配合走工伤认定的情况，公司应采取全面、细致且合法的措施来应对。通过积极沟通、提供协助、保留证据、寻求法律途径以及注意合规性和特殊情况的处理，公司既能有效保障员工的合法权益，也能维护自身的正常管理秩序和合法权益。