基层公务员签了五年协议后，在符合法定条件的情况下是可以辞职的。以下从不同角度为你详细分析：
一、公务员辞职的法定条件
根据《中华人民共和国公务员法》的相关规定，公务员有辞职的权利，但需要满足一定的条件。一般来说，公务员未涉及国家秘密等特殊职位，且未处于服务期（但服务期并非绝对限制，需结合具体协议和规定判断）或其他法定不得辞职的情形时，可以提出辞职申请。对于你提到的五年协议，这通常可能涉及服务期或特定岗位的约定，但服务期本身并不构成对公务员辞职权利的绝对剥夺，而是需要在辞职时考虑是否需要承担相应的违约责任或满足其他条件。
二、五年协议的具体性质与影响
服务期协议：如果五年协议明确为服务期协议，且公务员在服务期内辞职，可能需要按照协议约定承担一定的违约责任，如支付违约金或赔偿损失等。但违约责任的承担并不妨碍公务员行使辞职权，只是需要在辞职时一并处理相关违约事宜。
其他类型协议：如果五年协议并非单纯的服务期协议，而是包含了其他条款（如培训、保密、竞业限制等），则需要根据协议的具体内容来判断公务员辞职时需要承担的责任和义务。
三、辞职程序与注意事项
提交辞职申请：公务员应当向任免机关提出书面辞职申请，并说明辞职的理由和依据。
任免机关审批：任免机关应当在收到辞职申请后的一定期限内（通常为三十日）予以审批，并作出是否同意辞职的决定。
办理离职手续：如果任免机关同意辞职，公务员应当按照规定办理离职手续，包括交接工作、归还公物、结清财务等。
注意协议条款：在辞职过程中，公务员应当仔细审查五年协议的具体条款，了解辞职时需要承担的责任和义务，并做好相应的准备。
四、特殊情况下的辞职
如果公务员在五年协议期间遇到特殊情况（如患严重疾病、家庭变故等），且这些情况符合《公务员法》中规定的可以提前退休或辞职的情形，公务员可以依法提出辞职申请，并可能不需要承担违约责任或只需承担部分责任。
建议：如果你作为基层公务员，在签了五年协议后想要辞职，建议先仔细审查协议的具体条款，了解辞职时需要承担的责任和义务。同时，也可以向任免机关咨询辞职的具体程序和要求，以便更好地准备辞职申请和办理离职手续。如果你在辞职过程中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和帮助。