针对您提出的“事业单位职工被单位罚款是否合法”的问题，以下是我的详细解答：

首先，我们需要明确“罚款”这一概念在事业单位中的适用性。通常，罚款是行政处罚权的一种，由具有行政处罚权的行政机关来实施。而事业单位，并非行政机关，因此并不具备直接的行政罚款权力。

然而，事业单位在特定条件下，确实可以对员工进行经济扣减，但这并不等同于行政处罚意义上的“罚款”。这种经济扣减通常基于以下两种情形：

1. 内部规章制度：

   • 事业单位可以制定合法合理的内部规章制度，明确员工在违反特定规定或造成经济损失时应承担的经济责任。
   • 这些规章制度必须通过民主程序制定，如职工代表大会等，确保员工的参与和知情权。
   • 规章制度中应详细规定经济扣减的具体情形、标准和程序，以保证其公正性和透明度。

2. 合同约定：

   • 如果员工与事业单位签订的聘用合同中有关于违约经济责任等相关明确约定，当员工违反合同约定时，单位可以依据合同要求员工承担一定的经济责任。
   • 合同中的约定必须清晰、具体，且符合法律法规的规定，不能侵犯员工的合法权益。

在事业单位对员工进行经济扣减时，必须遵循以下原则以保障员工的合法权益：

• 公平公正原则：事业单位在处理员工违纪行为时，应确保处理过程公平公正，不偏袒任何一方。
• 沟通协商原则：如果员工认为单位的经济扣减行为不合理或损害了自身合法权益，可以与单位进行沟通协商，要求单位说明依据和理由。
• 法律途径维权原则：若协商不成，员工可以向单位的上级主管部门反映情况，或通过劳动人事争议调解仲裁等法律途径来维护自己的权益。

此外，事业单位在处理员工违纪行为时，还可以考虑采用其他替代措施，如警告、记过、降低岗位等级、撤职、留用察看等。这些措施旨在维护单位秩序，促进员工遵守规章制度，提高工作效率，并减少因直接经济扣减可能引发的纠纷和矛盾。

综上所述，事业单位在合法合规的前提下，可以依据内部规章制度或合同约定对员工进行经济扣减，但这一权力应谨慎使用，并确保员工的合法权益得到充分保障。