关于自离时工资的扣除问题，这确实是一个涉及劳动法律法规的复杂议题。首先，要明确的是，员工自离时，其工资的扣除必须严格遵循相关法律法规，确保合法、合理、有序进行。

一、自离时工资的支付原则

员工自离前已经实际提供了劳动的，用人单位应当按照双方约定或公司规定的工资计算方式，支付相应的劳动报酬。这通常意味着，员工应获得其实际工作天数的工资，计算方式可能是月工资除以月计薪天数（如21.75天）得出日工资，再乘以实际出勤天数。对于计件工资的员工，则根据其实际完成的工作量和计件单价来计算。

二、自离可能导致的扣除项目

1. 经济损失赔偿：

   • 如果员工的自离行为给用人单位造成了直接经济损失，如未完成工作导致的额外费用、损坏公司财物等，用人单位有权要求赔偿。但赔偿金额需有充分证据支持，且每月从工资中扣除的部分不得超过员工当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则应按最低工资标准支付。

2. 未归还公司财物或借款：

   • 如果员工有未归还的公司财物或借款，用人单位在结算工资时可以进行相应扣除，但需确保这一扣除行为合法合规，并有明确的证据支持。

3. 违反竞业限制或服务期约定的违约金：

   • 如果员工与用人单位签订了竞业限制协议或服务期协议，并且自离行为构成违约，那么员工需要按照协议约定向用人单位支付违约金。但违约金的数额应当合理，且扣除方式需符合法律规定。

三、特殊情况及注意事项

• 未签订劳动合同的情况：

  • 如果用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同，那么即使员工自离，用人单位仍需按照法律规定支付相应工资及可能的双倍工资赔偿。

• 工资结算时间：

  • 用人单位应在解除或终止劳动合同时一次性付清劳动者工资。即使员工是自离，也需在完成工作交接或确定实际工作情况后及时结算。

• 法律途径解决争议：

  • 如果员工与用人单位就自离后的工资扣除问题发生争议，可以通过协商、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等途径解决。

四、建议与总结

• 对于用人单位而言，在扣除员工工资时必须严格遵守法律规定，确保扣除的合理性和合法性。同时，应建立健全的离职管理制度，明确离职流程和责任划分，以减少不必要的纠纷。

• 对于员工而言，在离职前应尽可能与用人单位进行充分沟通，并按照法律规定提前通知用人单位。如果认为工资结算存在不合理之处，应及时寻求法律援助或通过合法途径维护自己的权益。

综上所述，自离时工资的扣除是一个需要谨慎处理的问题。用人单位和员工都应严格遵守相关法律法规，确保工资的支付与扣除合法、合理、有序进行。