结论：合同由子公司变更到总公司且工作地点也发生变化，这一系列变动确实可能影响“N+1”的赔偿，但具体是否影响及影响程度，需根据实际情况判断，包括合同变更的合法性、员工是否同意变更、工作地点变更的合理性等因素。
分析：
合同变更的合法性：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，劳动合同的变更应当遵循平等自愿、协商一致的原则，且不得违反法律、行政法规的规定。如果合同变更未经员工同意，或者变更内容违反法律法规，那么这种变更可能是无效的。
- 在此情况下，如果子公司未经员工同意，擅自将合同变更至总公司，且工作地点也发生显著变化，员工有权拒绝这种变更，并可能因此获得经济补偿。
员工是否同意变更：
- 如果员工同意了合同的变更，包括工作地点的变更，那么通常意味着员工接受了新的工作条件。在这种情况下，如果后续因各种原因（如公司裁员、合同到期不续签等）导致员工离职，经济补偿的计算可能会基于新的合同条件，而不是原来的“N+1”标准（这里的“N”通常指的是员工在公司的工作年限，“1”指的是一个月的工资作为代通知金）。
- 但如果员工虽然同意了变更，但变更并非出于自愿，而是受到了公司的胁迫或欺诈，那么员工仍然有权在离职时主张按照原来的标准获得经济补偿。
工作地点变更的合理性：
- 工作地点的变更也是影响经济补偿的重要因素。如果工作地点变更对员工的生活产生了重大影响（如从城市中心搬到偏远地区），且公司没有提供相应的补偿或便利措施，那么员工有权拒绝这种变更，并可能因此获得经济补偿。
- 另一方面，如果工作地点变更对员工的生活影响不大，或者公司提供了合理的补偿和便利措施，那么员工可能更容易接受这种变更，且在经济补偿方面可能不会得到额外的支持。
建议：
- 对于员工：如果面临合同变更和工作地点变更的情况，应仔细阅读变更协议，了解自己的权利和义务。如果不同意变更，应及时与公司沟通并表达自己的意见。如果公司坚持变更且自己无法接受，可以考虑寻求法律援助或提起劳动仲裁。
- 对于公司：在进行合同变更和工作地点变更时，应充分尊重员工的意愿和权益，确保变更的合法性和合理性。如果变更可能对员工产生重大影响，应提前与员工沟通并提供相应的补偿和便利措施。
可能后果：
- 如果合同变更和工作地点变更未经员工同意或违反法律法规，员工有权拒绝变更并可能获得经济补偿。
- 如果员工同意了变更但后续因各种原因离职，经济补偿的计算可能会基于新的合同条件。
- 如果因工作地点变更导致员工生活受到重大影响且公司未提供合理补偿，员工可能因此获得额外的经济补偿或支持。
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