针对您提出的“运输香烟超过5万怎么处罚”的问题，我将结合相关法律法规，为您详细解答。
首先，需要明确的是，运输香烟超过一定价值或数量，且未经烟草专卖行政主管部门许可，是违法行为，将受到法律的制裁。具体来说，当非法运输卷烟的价值超过5万元，或数量超过100件（每1万支为1件）时，即可能构成“情节严重”，从而面临刑事处罚。
一、行政处罚
在未达到刑事处罚标准前，若运输香烟的价值或数量虽超过一定限额但尚未构成犯罪，烟草专卖行政主管部门将依法进行行政处罚。这些处罚措施包括：
罚款：根据违法情节，罚款金额通常为违法运输的烟草专卖品价值的20%至50%。这一规定旨在通过经济手段惩罚违法行为，并起到震慑作用。
没收违法所得：烟草专卖行政主管部门有权没收因违法运输烟草专卖品所获得的全部收入，以此剥夺违法行为人的经济利益。
收购烟草专卖品：在某些情况下，烟草专卖行政主管部门可以按照查获地省级烟草专卖行政主管部门出具的上年度烟叶平均收购价格的70%收购违法运输的烟叶，以及按照市场批发价格的70%收购违法运输的除烟叶外的其他烟草专卖品。
二、刑事处罚
若运输香烟的价值超过5万元，或数量超过100件，且符合其他构成非法经营罪的条件（如多次非法经营、造成恶劣影响等），则可能触犯《中华人民共和国刑法》中的非法经营罪。根据法律规定，非法经营罪情节严重的可处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金。若情节特别严重，处罚将更为严厉。
三、特殊情形下的处理
情节轻微：若违法运输的烟草专卖品价值虽超过一定限额，但情节轻微（如初次违法、数量不大、主动配合调查等），烟草专卖行政主管部门可能会根据具体情况从轻、减轻处罚。
抗拒检查或其他严重情节：若存在抗拒检查、利用伪装或特种车辆逃避检查、非法运输走私烟草专卖品等严重情节，处罚将更加严厉，可能包括更高的罚款、没收违法运输的烟草专卖品以及刑事责任追究。
四、建议与总结
为了避免不必要的法律风险，我建议您严格遵守烟草专卖法律法规，不要未经许可运输烟草专卖品。若您对烟草行业有兴趣，应通过合法途径参与和经营，如申请烟草专卖许可证等。同时，也请您提醒身边的人注意遵守相关法律法规，共同维护良好的市场秩序和社会环境。
总之，运输香烟超过5万元将面临严重的法律后果，包括行政处罚和可能的刑事处罚。因此，请务必遵守相关法律法规，不要心存侥幸心理。