未经许可运输3000条香烟，将面临烟草专卖行政处罚，情节严重的可能构成非法经营罪，需承担刑事责任。具体分析如下：

1. 行政处罚层面
   根据《中华人民共和国烟草专卖法》第二十一条及《烟草专卖法实施条例》第五十二条，无烟草专卖品准运证运输烟草专卖品（包括香烟）的，由烟草专卖行政主管部门处以罚款，并可按照市场批发价格的70%收购违法运输的香烟。
   

• 罚款标准：若运输香烟价值超过5万元，或运输数量超过10万支（即500条），将被认定为“情节严重”，罚款额度为违法运输香烟价值20%以上50%以下。
  
• 香烟处理：违法运输的香烟将被烟草专卖部门依法收购，收购价格按市场批发价的70%计算。
  
• 本案情形：3000条香烟（即60万支）远超500条的“情节严重”标准，若无法提供合法准运证，将面临高额罚款及香烟被收购的处罚。

1. 刑事责任层面
   若运输行为同时符合《刑法》第二百二十五条非法经营罪的构成要件，可能被追究刑事责任：
   

• 立案标准：根据最高检、公安部《关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（二）》，非法经营烟草专卖品，扰乱市场秩序，情节严重的，立案追诉标准包括：
  
  • 非法经营数额在5万元以上，或违法所得数额在2万元以上；
    
  • 非法经营卷烟20万支以上（即4000条）；
    
  • 曾因非法经营烟草专卖品三年内受过二次以上行政处罚，又非法经营的。
    
• 本案情形：3000条香烟虽未达到4000条的刑事立案数量标准，但若运输价值超过5万元（按市场价计算），或存在其他严重情节（如多次运输、暴力抗法等），仍可能构成非法经营罪，面临五年以下有期徒刑或拘役，并处或单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的（如数额巨大、造成严重后果），处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或没收财产。

1. 特殊情形说明
   

• 合法运输情形：若运输者持有烟草专卖品准运证，或属于烟草专卖品生产企业、批发企业通过合法渠道调拨、配送香烟，则不构成违法。
  
• 共犯风险：若明知他人从事非法经营烟草活动仍提供运输帮助，可能被认定为共同犯罪，承担相应刑事责任。

建议：若您或他人涉及此类情况，请立即停止运输行为，并主动向烟草专卖部门说明情况，配合调查。如有进一步法律疑问，可直接向我咨询，我将结合具体细节为您提供专业分析。