结论：该承包合同的有效性需分情况讨论，若不符合法定程序，合同可能无效或效力待定；若存在追认或补正程序，合同可能有效。以下从不同角度详细分析：

一、合同生效的法定程序要求

根据《中华人民共和国民法典》及相关法律规定，农村土地承包合同（尤其是涉及集体资产或村民重大利益的合同）通常需满足以下程序要求：

1. 公开招标或民主议定程序：若承包项目属于《农村土地承包法》规定的“家庭承包以外的其他方式承包”（如招标、拍卖、公开协商等），原则上需通过公开招标或村民会议、村民代表会议民主议定程序确定承包方。未公开招标且未经村民会议或村民代表会议通过的，可能违反法定程序。
2. 村民会议或村民代表会议的决策权限：根据《村民委员会组织法》，涉及村民利益的重大事项（如集体资产承包）需经村民会议或村民代表会议讨论决定。若合同未履行此程序，可能因“违反法律、行政法规的强制性规定”而被认定无效（《民法典》第153条）。

二、合同效力的具体分析

1. 若合同内容违反强制性规定
   若承包项目属于必须公开招标或需村民会议决议的情形（如集体林地、荒地、水面等承包），且未履行法定程序，合同可能因“违反法律强制性规定”而无效。例如：

   • 某村将集体林地承包给个人，未公开招标且未经村民会议通过，仅由支部两人签字，法院可能认定合同无效（《农村土地承包法》第48条）。
     
   • 例外：若承包项目属于家庭承包（如耕地、草地），且未涉及集体资产处置，可能不适用公开招标程序，但仍需符合民主议定程序。

2. 若合同存在效力待定情形
   若支部两人签字属于“无权代理”或“超越职权”（如未获村民会议授权），合同效力待定。此时需看村民会议或村民代表会议是否追认：

   • 若事后追认（如补开会议通过合同），合同有效；
     
   • 若拒绝追认，合同自始无效（《民法典》第171条）。

3. 若合同形式或内容存在瑕疵
   即使程序违法，若合同已实际履行且村民未提出异议，法院可能根据“维护交易安全”原则，结合实际情况部分认定合同效力（如履行期限、价款等条款有效，但程序违法部分无效）。但此情形需具体分析，不构成普遍规则。

三、法律建议

1. 对承包方：

   • 立即核查合同是否履行法定程序（如公开招标、村民会议决议等）；
     
   • 若程序违法，尽快与村委会协商补正程序（如补开村民会议追认）；
     
   • 若无法补正，可主张合同无效并要求返还已支付费用，但需承担部分过错责任（如未尽审查义务）。

2. 对村委会：

   • 若合同已签订，应尽快召开村民会议或村民代表会议补正程序；
     
   • 若村民反对，应终止合同并协商赔偿，避免被诉要求继续履行或赔偿损失。

3. 对村民：

   • 若认为合同违法，可向乡镇政府反映或直接起诉村委会，要求确认合同无效；
     
   • 需注意诉讼时效（一般为知道或应当知道权利受损之日起3年）。

四、可能后果

1. 合同无效：承包方需返还土地，村委会返还已收款项，双方按过错分担损失（如村委会承担主要责任）。
   
2. 合同有效：若程序瑕疵被补正或法院认定不影响效力，承包方继续履行合同，村委会不得无故解除。
   
3. 部分无效：如合同期限超过法定最长年限（如耕地承包期超过30年），超出部分无效。

提示：农村土地承包合同效力问题需结合具体项目类型、程序瑕疵程度、实际履行情况综合判断。若有进一步细节（如承包标的、期限、是否支付对价等），可向我补充说明，以便更精准分析。