政府债工程款打折是否合法，不能一概而论，需要分情况讨论：

1. 若政府债工程款打折是基于合法有效的合同约定或双方协商一致：

   • 在这种情况下，打折行为是合法的。合同是双方意思表示一致的产物，只要合同内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么合同中的条款，包括工程款打折的条款，都是有效的。双方应当按照合同约定履行各自的义务。
   • 举例：如果政府与承包商在合同中明确约定，在特定条件下（如工程提前完成、质量达标等），工程款可以享受一定的折扣，且这一约定不违反相关法律法规，那么这种打折行为就是合法的。

2. 若政府债工程款打折缺乏合法依据或违反法律法规：

   • 在这种情况下，打折行为可能是不合法的。例如，如果政府单方面决定对工程款进行打折，而没有与承包商进行协商，或者打折行为违反了相关法律法规的规定（如低于成本价支付工程款等），那么这种打折行为就可能构成违法。
   • 法律后果：如果政府债工程款打折行为违法，承包商有权要求政府按照合同约定支付全额工程款，并可能要求政府承担违约责任或赔偿损失。同时，政府的相关行为也可能受到行政监督或法律制裁。

3. 特殊情况下的考虑：

   • 在某些特殊情况下，如政府面临财政困难或紧急情况，可能需要与承包商协商对工程款进行打折或延期支付。但这种情况下，打折或延期支付应当基于双方协商一致，并尽可能签订书面协议以明确双方的权利和义务。
   • 建议：对于政府而言，在决定对工程款进行打折或延期支付时，应当充分考虑法律法规的规定和承包商的合法权益，避免引发不必要的法律纠纷。对于承包商而言，在签订合同时应当仔细审查合同条款，确保自己的权益得到充分保障；在面临政府打折或延期支付的要求时，应当及时与政府进行沟通协商，并尽可能签订书面协议以明确双方的权利和义务。

总结与建议：政府债工程款打折是否合法取决于具体的情况和法律法规的规定。在涉及此类问题时，建议双方首先审查合同条款和相关法律法规，明确各自的权利和义务；如果无法达成一致意见或存在争议，可以寻求法律途径解决纠纷。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。