公益性岗位员工在休年休假期间，工资是不应被扣除的。以下是对此问题的详细分析：
法律依据：
- 根据《职工带薪年休假条例》第二条的规定，机关、团体、企业、事业单位、民办非企业单位、有雇工的个体工商户等单位的职工，只要连续工作1年以上，均享有带薪年休假。公益性岗位作为政府为解决就业困难群体而特设的非营利性公共服务岗位，其从业者同样属于劳动者的范畴，与用人单位建立了劳动关系，因此也受该条例的保护，享有带薪年假的权利。
- 该条例还明确规定，职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。这意味着，公益性岗位员工在休年休假时，其工资应照常发放，不应被扣除。
年休假天数的确定：
- 年休假的天数依据职工的累计工作时间来确定。累计工作满1年但不满10年的职工，每年可享受5天的年休假；累计工作满10年但不满20年的职工，每年可享受10天的年休假；累计工作满20年以上的职工，则每年可享受15天的年休假。
- 公益性岗位员工同样适用这一规定，其年休假天数应根据其累计工作时间来确定。
特殊情况下的处理：
- 虽然公益性岗位员工有权享受年假，但在实际操作中，可能会因工作特点、岗位需求等因素，在安排年休假时受到一定限制。若单位因工作需要无法安排职工休年休假，需经职工本人同意，并且应按照该职工日工资收入的300%支付未休年休假的工资报酬。
- 然而，这并不意味着单位可以随意扣除员工休年休假期间的工资。只有在员工同意不休年休假，并且单位按照法律规定支付了相应的工资报酬的情况下，才不构成违法。
实际操作建议：
- 公益性岗位员工在休年休假前，应提前了解单位的规章制度和请假流程，确保自己的请假符合规定。
- 如果单位在员工休年休假期间扣除工资，员工可以与单位进行沟通协商，要求单位按照法律规定支付工资。
- 如果沟通无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
总结：公益性岗位员工在休年休假期间，其工资是不应被扣除的。这是由《职工带薪年休假条例》明确规定的。如果单位违反这一规定，员工有权要求单位支付相应的工资报酬，并可以通过法律途径维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。