结论：公司有案子（即涉及诉讼或仲裁等法律纠纷）时，是否可以进行股权变更需视具体情况而定，但通常法律并不禁止在诉讼期间进行股权变更，不过需注意可能面临的法律风险和限制。

一、法律对股权变更的基本规定

股权变更，通常指的是公司股东将其持有的股份转让给其他股东或第三方，从而改变公司的股权结构。根据《公司法》及相关法律法规，股权变更一般需要满足以下条件：

1. 股东同意：股权转让需得到其他股东的同意，特别是在有限责任公司中，股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。
2. 书面协议：股权转让应当签订书面转让协议，明确双方的权利和义务。
3. 公司登记：股权转让后，公司应当向工商行政管理部门办理变更登记，以公示股权结构的变更。

二、诉讼期间股权变更的特殊性

在公司涉及诉讼或仲裁等法律纠纷时，股权变更可能受到以下限制或影响：

1. 法院或仲裁机构的限制：在某些情况下，法院或仲裁机构可能会根据案件需要，对公司的股权变更进行限制，以防止当事人通过股权变更逃避法律责任或损害其他债权人的利益。例如，在涉及公司财产保全的案件中，法院可能会冻结公司的股权，禁止其转让。
2. 债权人保护：如果公司存在未清偿的债务，股权变更可能会影响债权人的利益。因此，在进行股权变更时，需要确保债权人的权益不受损害，否则可能会面临法律纠纷。
3. 合同或章程的限制：公司的合同或章程中可能包含对股权变更的限制性条款，如股东转让股权需经过特定程序或满足特定条件等。

三、诉讼期间进行股权变更的建议

1. 咨询专业律师：在进行股权变更前，建议咨询专业律师，了解当前案件对公司股权变更的具体影响，以及可能面临的法律风险。
2. 确保合规性：确保股权变更符合《公司法》及相关法律法规的规定，以及公司合同和章程的要求。
3. 保护债权人利益：如果公司存在未清偿的债务，应确保股权变更不会损害债权人的利益，必要时可与债权人协商达成一致意见。
4. 及时办理变更登记：股权转让后，应及时向工商行政管理部门办理变更登记，以公示股权结构的变更，避免后续纠纷。

四、可能面临的法律后果

如果在诉讼期间未经允许擅自进行股权变更，可能会面临以下法律后果：

1. 股权转让无效：如果股权变更违反了法律法规或公司合同、章程的规定，该股权转让可能会被认定为无效。
2. 法律责任：如果股权变更损害了其他股东或债权人的利益，相关责任人可能需要承担法律责任，包括赔偿损失等。
3. 影响案件审理：如果股权变更影响了案件的审理或执行，法院或仲裁机构可能会对相关责任人采取相应的法律措施。

总结来说，公司有案子时进行股权变更需谨慎行事，确保符合法律法规和公司合同、章程的要求，并咨询专业律师以规避潜在的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。