结论：在男子婚内代孕，妻子起诉离婚时男人拒绝与代孕女作司法鉴定的情况下，妻子可以通过收集其他证据来证明代孕事实，进而在离婚诉讼中主张自己的权益。以下是对此问题的详细分析：

一、法律背景与代孕行为的定性

首先，需要明确的是，代孕行为在我国是违法的，它违反了公序良俗和计划生育的基本国策。因此，无论代孕行为是否得到男子的同意或参与，都是不被法律所认可的。在离婚诉讼中，如果妻子能够证明男子存在婚内代孕的行为，这将成为影响财产分割、子女抚养权归属等重要因素。

二、司法鉴定的作用与局限性

司法鉴定在确认亲子关系方面具有重要作用，但它并非唯一证据。在男子拒绝与代孕女作司法鉴定的情况下，妻子可以寻求其他证据来证明代孕事实。这些证据可能包括：

1. 代孕协议或相关记录：如果存在书面或电子形式的代孕协议，或者有关代孕的聊天记录、邮件等，这些都可以作为证明代孕事实的直接证据。
2. 医疗记录：代孕过程中涉及的医疗记录，如胚胎移植记录、孕期检查记录等，也可以作为证明代孕事实的间接证据。
3. 证人证言：如果知道代孕事实的第三方愿意出庭作证，他们的证言也可以作为辅助证据。

三、妻子的法律权益与诉讼策略

1. 收集证据：妻子应积极收集上述提到的各类证据，以形成完整的证据链，证明男子存在婚内代孕的行为。
2. 提起离婚诉讼：在收集到足够证据后，妻子可以向法院提起离婚诉讼，并在诉讼中主张自己的权益，如要求多分财产、获得子女抚养权等。
3. 应对男子拒绝司法鉴定：如果男子拒绝与代孕女作司法鉴定，妻子可以在诉讼中向法院说明情况，并请求法院根据其他证据来认定代孕事实。法院在审理案件时，会综合考虑所有证据，并作出公正判决。

四、可能的法律后果

1. 财产分割：如果法院认定男子存在婚内代孕的行为，这可能会成为影响财产分割的重要因素。妻子有可能因此获得更多的财产份额。
2. 子女抚养权：如果代孕所生的子女与妻子形成了法律上的母子/女关系（如通过收养等程序），妻子有权主张子女的抚养权。即使子女与妻子没有直接的血缘关系，法院也会根据子女的最佳利益原则来判决抚养权的归属。
3. 精神损害赔偿：男子婚内代孕的行为可能给妻子造成精神上的伤害，妻子有权在离婚诉讼中主张精神损害赔偿。

建议：在整个过程中，妻子应保持冷静和理智，积极收集证据并寻求法律帮助。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供更详细和专业的法律指导。