员工持股纠纷是否算劳动仲裁，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度为你详细分析：
若员工持股纠纷与劳动关系紧密相关：
- 例如，纠纷涉及员工因持股而与公司产生的关于工资、奖金、福利、解雇、辞退、工作时间、休息休假等劳动权益方面的争议，那么这类纠纷通常会被视为劳动争议的一部分，可以申请劳动仲裁。因为劳动仲裁主要处理的就是用人单位与劳动者之间因劳动权利和义务而产生的纠纷。
- 举例：员工因公司未按照持股协议约定支付分红，而与公司产生争议，要求公司支付分红并赔偿损失。这种情况下，纠纷就与劳动关系紧密相关，可以申请劳动仲裁。
若员工持股纠纷主要涉及股权权益：
- 如果纠纷主要围绕股权的转让、行使、收益等股权权益方面，而不直接涉及劳动关系中的具体权益，那么这类纠纷可能不属于劳动仲裁的范畴，而更倾向于属于民事纠纷或商事纠纷。在这种情况下，当事人可能需要通过民事诉讼或商事仲裁等方式来解决纠纷。
- 举例：员工之间因股权转让价格、转让方式等产生争议，或者员工与公司之间因股权回购、股权行使等产生争议。这些情况下，纠纷主要涉及股权权益，不属于劳动仲裁的受理范围。
法律建议：
- 在处理员工持股纠纷时，首先应明确纠纷的性质和具体内容，判断其是否与劳动关系紧密相关。
- 如果纠纷属于劳动争议范畴，可以依法向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。
- 如果纠纷主要涉及股权权益，可能需要考虑通过民事诉讼或商事仲裁等方式来解决。
- 在处理纠纷过程中，建议咨询专业律师，以便更准确地判断纠纷性质、选择合适的解决方式，并维护自身合法权益。
可能法律后果：
- 如果错误地将不属于劳动仲裁范畴的纠纷申请劳动仲裁，可能会被仲裁委员会不予受理或驳回申请，从而浪费时间和精力。
- 如果纠纷属于劳动仲裁范畴但未及时申请仲裁，可能会错过仲裁时效，导致无法再通过劳动仲裁方式维护自身权益。
因此，在处理员工持股纠纷时，务必谨慎判断纠纷性质，并选择合适的解决方式。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。