结论：小区有业委会的情况下，物业执行政府指导价二级标准是否合法，需结合当地政府指导价的具体规定、物业服务合同内容以及业委会的决策情况综合判断。以下从不同角度详细分析：
一、政府指导价的适用范围与标准
政府指导价的定义：政府指导价是指由政府价格主管部门或者其他有关部门，按照定价权限和范围规定基准价及其浮动幅度，指导经营者制定的价格。在物业服务领域，政府指导价通常针对普通住宅小区的物业服务收费，旨在保障业主的基本权益，防止物业服务企业乱收费。
二级标准的含义：政府指导价通常会根据物业服务的内容、质量等因素，将物业服务划分为不同的等级，如一级、二级等。每个等级对应不同的收费标准。二级标准通常意味着物业服务企业在提供基础服务的同时，还提供了一定程度的增值服务，但收费标准相对一级标准会低一些。
合法性判断：如果当地政府明确规定了普通住宅小区的物业服务收费应执行政府指导价，并且二级标准是政府指导价中的一个合法等级，那么物业执行二级标准本身并不违法。但关键在于，这一标准是否得到了业委会的认可或合同约定。
二、物业服务合同的内容与效力
合同约定优先：根据《民法典》的相关规定，物业服务合同是物业服务企业与业主之间约定物业服务内容和收费标准的法律文件。如果物业服务合同中明确约定了执行政府指导价二级标准，那么这一约定对双方均具有法律约束力。
业委会的决策权：业委会作为业主大会的执行机构，有权代表业主与物业服务企业签订物业服务合同。在签订合同前，业委会应充分征求业主的意见，确保合同内容符合大多数业主的意愿。如果业委会在未经业主同意的情况下擅自决定执行二级标准，可能构成对业主权益的侵害。
三、业委会的决策程序与合法性
决策程序：业委会在决定物业服务收费标准时，应遵循一定的决策程序，如召开业主大会、征求业主意见、进行表决等。只有经过合法程序作出的决策，才能对业主产生法律约束力。
合法性审查：如果业委会的决策程序存在瑕疵，如未召开业主大会、未征求业主意见或表决结果未达到法定比例等，那么其作出的决策可能因程序违法而无效。在这种情况下，物业执行二级标准可能缺乏合法依据。
四、建议与措施
核查政府指导价文件：业主可以首先核查当地政府关于物业服务收费的指导价文件，了解二级标准是否合法以及具体的收费标准。
审查物业服务合同：业主应仔细审查物业服务合同的内容，特别是关于收费标准的条款。如果合同中明确约定了执行二级标准，且这一约定符合政府指导价的规定和业主的意愿，那么物业执行二级标准是合法的。
咨询业委会或物业服务企业：如果业主对物业服务收费标准有疑问或不满，可以咨询业委会或物业服务企业，了解其决策依据和收费标准的具体计算方式。
寻求法律援助：如果业主认为物业执行二级标准违法或侵害了其合法权益，可以寻求法律援助或向相关部门投诉举报，以维护自己的合法权益。
总结：小区有业委会的情况下，物业执行政府指导价二级标准是否合法，需结合当地政府指导价的具体规定、物业服务合同内容以及业委会的决策情况综合判断。业主应积极了解相关信息，维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。