针对您提出的“土地被违法确权登记是直接起诉还是打官司”的问题，首先明确结论：在土地被违法确权登记的情况下，您既可以选择直接提起行政诉讼（即“打官司”的一种形式），也可以先尝试通过行政复议等途径解决争议，具体选择取决于多种因素。
一、直接提起行政诉讼
法律依据：
- 根据《中华人民共和国行政诉讼法》的相关规定，公民、法人或者其他组织认为行政机关和行政机关工作人员的行政行为侵犯其合法权益，有权依照本法向人民法院提起诉讼。土地确权登记行为属于行政机关的具体行政行为，如果认为该行为违法，可以依法提起行政诉讼。
诉讼流程：
- 准备阶段：收集相关证据，如土地权属证明、确权登记文件、违法确权的证据等。
- 起诉阶段：向有管辖权的人民法院提交起诉状，明确被告、诉讼请求和事实理由。
- 审理阶段：法院将组织双方进行庭审，听取双方陈述和辩论，审查证据，并作出判决。
注意事项：
- 提起行政诉讼需满足一定的起诉条件，如原告与行政行为有利害关系、有明确的被告、有具体的诉讼请求和事实理由等。
- 诉讼过程中需遵循法定程序，如举证期限、庭审规则等。
二、先尝试行政复议
法律依据：
- 根据《中华人民共和国行政复议法》的相关规定，公民、法人或者其他组织认为具体行政行为侵犯其合法权益的，可以自知道该具体行政行为之日起六十日内提出行政复议申请。土地确权登记行为如果认为违法，也可以先申请行政复议。
复议流程：
- 申请阶段：向作出确权登记行为的行政机关的上一级行政机关提交行政复议申请书，明确复议请求和事实理由。
- 受理阶段：复议机关将审查申请是否符合受理条件，并决定是否受理。
- 审理阶段：复议机关将组织双方进行听证或书面审查，并作出复议决定。
注意事项：
- 行政复议具有高效、便捷的特点，且复议决定对原行政机关具有约束力。
- 如果对复议决定不服，仍可以依法提起行政诉讼。
三、选择建议
- 如果证据充分、事实清楚：且您希望尽快解决争议，可以选择直接提起行政诉讼。
- 如果希望先通过内部程序解决：或者对行政机关的处理有信心，可以先尝试申请行政复议。
- 无论选择哪种方式：都建议咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和指导。
最后，需要强调的是，土地确权登记问题涉及复杂的法律关系和事实认定，建议您在处理此类问题时务必谨慎行事，并寻求专业律师的帮助。如果您有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。