核心结论：若您已还清款项且对方写了结案申请，一般情况下案件已了结；但需根据具体情况判断是否需要进一步采取措施，如确认结案申请的法律效力、保留还款证据等。以下是具体分析：

1. 确认结案申请的法律效力
   首先，需要明确对方所写的“结案申请”是否具有法律效力。如果该申请是在法院或仲裁机构主持下达成，并由相关机构出具了结案文书（如调解书、裁决书等），则案件已正式了结，您无需再承担还款责任。

   • 若已通过司法程序结案：结案文书具有强制执行力，对方若反悔或再次主张权利，您可凭结案文书进行抗辩。
     
   • 若仅为双方私下协商的结案申请：需进一步确认其是否构成有效的债务清偿协议。若对方未明确放弃剩余权利，可能存在后续纠纷风险。

2. 保留还款证据的重要性
   无论结案申请的形式如何，您均需保留还款的完整证据（如转账记录、收条、聊天记录等），以证明您已履行还款义务。

   • 若对方事后反悔：还款证据是您维护自身权益的关键，可避免被认定为“未还款”或“还款不足”。
     
   • 若结案申请存在瑕疵：如对方未签字、内容模糊等，还款证据可辅助证明案件实际已解决。

3. 主动沟通或法律确认（可选）

   • 若对结案申请的效力存疑：可要求对方出具书面确认文件（如《债务清偿确认书》），明确双方权利义务终止。
     
   • 若涉及复杂情况（如多方债务、担保等）：建议通过律师协助审查结案申请的合法性，避免遗漏关键条款。

行动建议：

1. 整理所有还款凭证及结案申请文件，核对内容是否一致；
   
2. 若结案申请未通过司法程序确认，可主动联系对方补充书面协议；
   
3. 如遇对方纠缠或威胁，立即咨询律师并考虑通过法律途径解决。
   

如有其他细节需要进一步分析，可直接向我说明具体情况。