被告在还清欠款后，确实需要采取一定措施来申请或确认结案，但具体流程取决于案件所处的阶段和性质。以下是从不同角度对这一问题的详细解答：
执行阶段结案流程：
- 若案件已进入执行阶段，被告在还清欠款后，应首先向原告索取收款凭证或由原告出具收条，这是证明债务已经结清的关键证据。
- 随后，原告（申请执行人）可以向执行法院提交结案申请，明确说明被告已按生效法律文书要求完成还款，并请求法院对执行案件予以结案。
- 法院在收到申请后，将核实相关情况，包括还款凭证等证明材料，确认无误后办理结案手续，并更新案件状态。
诉讼阶段结案流程：
- 若被告在判决前或判决后自动履行还款义务，原、被告双方可以共同前往法院，由原告向法官说明情况。
- 此时，原告可以选择申请撤诉，或者由法院根据案件已履行完毕的情况做结案处理。撤诉通常意味着原告放弃了对被告的诉讼请求，而法院结案则是对案件处理结果的正式确认。
调解案件结案方式：
- 如果案件是通过调解方式解决的，被告可以与原告一起向法院申请制作调解书。调解书经双方当事人签收后，即具有法律效力，并可作为结案的依据。
- 调解书不仅确认了双方的权利义务关系，还明确了案件的处理结果，因此是结案的重要凭证。
法院依职权结案：
- 在某些情况下，执行法院也有权在核实到被告已足额履行还款义务后，依职权主动对案件进行结案处理。
- 这通常涉及法院工作人员对案件执行情况的审核，确认无误后按照内部流程办理结案手续。这种方式虽然不常见，但在特定情况下也是可能的。
法律建议：
- 被告在还清欠款后，务必确保获得充分的还款凭证或证明材料，以便在申请结案时提供有力支持。
- 如果对结案流程不熟悉或遇到困难，建议及时咨询专业律师（即我，江海龙律师，专注于婚姻家庭、债权债务领域），以获取更具体的法律指导和帮助。
- 在整个结案过程中，保持与法院和原告的沟通畅通，确保信息的及时传递和问题的及时解决。
可能后果：
- 如果被告未按照法定程序申请结案或未提供充分的证明材料，可能会导致结案手续无法顺利办理，进而影响案件的最终处理结果。
- 在某些情况下，如果被告未履行完还款义务就擅自申请结案，可能会面临法律责任和信用损失。
综上所述，被告在还清欠款后，应根据具体情况选择合适的结案方式，并确保债务已完全清偿，并提供充分的证明材料。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。