在挪用资金案件中，即使公司不追究，也并不必然导致不起诉，是否起诉需根据具体犯罪事实、社会危害性以及法律规定来综合判断。以下从不同角度为你详细分析：

从案件性质分析

1. 不属于自诉案件 挪用资金罪是公诉案件，并非刑事自诉案件。公诉案件由检察机关代表国家提起公诉，不存在公司作为自诉人决定是否起诉的情况。这意味着，即便公司出于各种原因不想追究行为人的责任，检察机关仍可能依据法律规定介入案件。
2. 公诉角度分析
   • 一般情况：挪用资金罪不仅侵犯了公司财产的使用权，还破坏了社会主义市场经济秩序。公司不追究只能表明公司对行为人有一定的谅解态度，但不能替代国家公权力对犯罪行为的追究。根据《中华人民共和国刑法》第二百七十二条规定，挪用本单位资金数额较大、超过三个月未还，或进行营利活动、非法活动的，将受到相应的刑事处罚。例如，某公司员工挪用公司资金50万元用于个人炒股，超过三个月未归还，即便公司领导表示不追究，检察机关仍可能对该员工提起公诉。
   • 特殊情况：
     • 法定不起诉：若存在情节显著轻微、危害不大；犯罪已过追诉时效；经特赦令免除刑罚；依照刑法告诉才处理的犯罪且没有告诉或撤回告诉；犯罪嫌疑人、被告人死亡等情形，检察机关应作出不起诉决定。不过，挪用资金罪一般不属于这些法定不起诉的范畴。
     • 酌定不起诉：对于犯罪情节轻微，不需要判处刑罚或免除刑罚的，检察机关可以作出不起诉决定。比如，挪用资金数额较小、案发后积极退赃退赔并取得公司谅解等，综合全案判断犯罪情节轻微时，检察机关可能基于自由裁量权作出不起诉决定。但这种情况需要满足多个条件，且检察机关的自由裁量权也是在法律框架内行使的。
     • 证据不足不起诉：若经过补充侦查，人民检察院仍认为证据不足，不符合起诉条件的，应作出不起诉决定。这是基于证据规则的考量，与公司的态度无关。

从犯罪事实与社会危害性分析

挪用资金的数额和情节是影响是否起诉的重要因素。如果数额较大或情节严重，如长时间未归还、用于非法活动等，无论公司是否追究，都更有可能被提起公诉。例如，某员工挪用公司资金100万元用于赌博，即使公司表示不追究，由于该行为社会危害性极大，检察机关仍会依法提起公诉，以维护社会的公平正义和法律秩序。因为刑事诉讼不仅仅是为了保护公司的权益，更是为了维护社会的公共利益和法律秩序。

法律建议

涉及挪用资金的行为人应及时了解可能的法律后果，并积极配合相关部门的调查和处理工作。同时，各公司也应加强内部管理，建立健全财务制度和监督机制，防范挪用资金等违法犯罪行为的发生。如果你有挪用资金相关的法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。