1991年发生的土地纠纷，现行《农村土地承包法》原则上不直接适用，但需结合纠纷性质、法律修订时间及“法不溯及既往”原则综合判断。以下是具体分析：

一、现行《农村土地承包法》的生效时间与溯及力

现行《农村土地承包法》于2003年3月1日正式实施，此前土地纠纷的法律依据主要是1988年修订的《土地管理法》、1998年修订的《土地管理法》及地方性法规、政策文件。根据“法不溯及既往”原则（即法律仅对生效后的行为产生约束力），1991年发生的纠纷原则上适用当时的法律，而非现行法。

二、需分情况讨论的例外情形

若纠纷涉及以下情形，现行法可能间接适用或作为参考：

1. 纠纷持续至现行法生效后
   若1991年的纠纷未解决，且争议行为（如土地占用、承包合同履行）持续至2003年后，现行法可能对后续行为产生约束。例如：承包合同在1991年签订，但2003年后因调整承包地引发争议，此时需结合现行法关于“承包期延长”“稳定承包关系”等规定处理。

2. 现行法对历史问题的特别规定
   现行法中部分条款明确规定了历史遗留问题的处理方式。例如：

   • 第二十七条：承包期内，发包方不得调整承包地，但因自然灾害严重毁损等特殊情形可个别调整，并需经本集体经济组织成员的村民会议三分之二以上成员或代表同意。若1991年调整承包地未履行法定程序，现行法可作为判断调整行为合法性的参考。
   • 第三十五条：承包期内发包方不得单方解除合同，若1991年发包方违法收回承包地，现行法可支持承包方主张权利。

3. 纠纷涉及土地确权或登记
   若1991年纠纷因土地权属不清引发，而现行法实施后开展了土地确权登记（如2013年启动的农村土地承包经营权确权登记颁证工作），确权结果可能作为解决纠纷的依据，但需以历史权属证明为基础。

三、实务建议

1. 收集历史证据：重点查找1991年纠纷发生时的承包合同、土地使用证明、村委会决议、证人证言等，这些是适用当时法律的关键材料。
2. 结合现行法主张权利：若纠纷涉及承包地被违法收回、调整或侵害承包经营权，可引用现行法中保护承包方权益的条款（如第三十五条、第五十六条），要求恢复原状或赔偿损失。
3. 咨询专业律师：土地纠纷常涉及地方政策、历史遗留问题及证据固定，建议携带完整材料面谈，以便律师结合具体案情分析法律适用及维权策略。

总结：1991年土地纠纷原则上适用当时法律，但若纠纷持续至现行法生效后、涉及现行法特别规定或需通过确权解决，现行法可能成为重要依据。具体需结合证据和案情综合判断，如有疑问可进一步向我咨询。