基层水利水电工程事业编定向生满6年后是否可以续约以及是否保留编制，需分情况讨论，具体如下：

1. 续约可能性
   定向生服务期满后是否续约，主要取决于原定向协议的约定。若协议中明确约定服务期满后自动续约，或双方协商一致续签合同，则可续约；若协议未约定续约条款，或单位因岗位调整、编制限制等原因不再续签，则可能无法续约。
   建议：服务期满前主动与单位沟通，明确续约意向及条件，并留存书面沟通记录。

2. 编制保留问题
   事业编制的保留通常与劳动关系是否存续直接相关：

   • 若续约成功且单位编制未超限，一般可保留编制；
     
   • 若未续约或单位因政策调整（如机构改革、编制冻结）无法续签，编制可能被收回，但部分地区可能通过“调岗不调编”等方式过渡，需以地方政策为准。
     关键点：编制是否保留需结合单位编制管理规定及地方人社部门政策，建议提前向单位人事部门或当地人社局咨询。

3. 特殊情形提示

   • 定向协议违约责任：若服务期未满擅自离职，可能需支付违约金或影响个人征信（具体以协议约定为准）；
     
   • 政策变动风险：部分地区可能因水利行业改革（如企业化改制）调整编制政策，需关注地方动态；
     
   • 跨地区差异：不同省份对事业编定向生的管理细则可能不同（如服务期长度、续约条件），需以当地规定为准。

行动建议：

1. 查阅入职时签订的《定向培养协议》或《事业单位聘用合同》，重点关注服务期、续约、编制等条款；
   
2. 向单位人事部门书面确认续约政策及编制保留条件；
   
3. 若涉及地方政策，可拨打12333（人社服务热线）或访问当地政府官网查询最新文件。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体条款解读或政策分析。