针对您提出的问题，关于公司员工离职后不愿配合进行手机卡实名制变更的情况，我们可以从以下几个方面来分析和解决：
首先，需要明确的是，手机卡实名制是为了保障通信安全、维护用户权益而实施的一项重要制度。在公司员工使用公司名义办理的手机卡上，如果员工离职后不愿配合进行实名制变更，确实会给公司带来一定的管理困扰和法律风险。
一、明确责任与义务
公司责任：公司作为手机卡的原始申请者，有责任确保手机卡信息的准确性和实时更新。员工离职后，公司应及时联系运营商，办理手机卡的实名制变更手续。
员工义务：虽然员工已经离职，但考虑到手机卡在其名下，从法律角度讲，员工有义务配合公司进行实名制变更，以避免可能产生的法律风险和责任。
二、解决方案
协商沟通：首先，公司应尝试与员工进行友好协商，解释实名制变更的重要性和必要性，以及不配合可能带来的后果。通过沟通，争取员工的理解和支持。
提供便利：为了降低员工的配合成本，公司可以主动与运营商联系，了解实名制变更的具体流程和要求，并为员工提供必要的协助和指导。
法律途径：如果员工坚持不配合，公司可以考虑通过法律途径来解决问题。例如，可以向当地法院提起诉讼，要求员工履行配合义务。但需要注意的是，这种方式可能会耗费一定的时间和精力，且成本较高。
与运营商协商：公司还可以尝试与运营商协商，看是否可以由运营商直接进行手机卡的实名制变更，而无需员工本人到场。这需要根据具体的运营商政策和规定来确定。
三、预防措施
完善管理制度：公司应建立健全手机卡管理制度，明确手机卡的申请、使用、变更和注销流程，以及员工的责任和义务。
加强员工培训：在员工入职时，应对其进行手机卡管理制度的培训，让员工了解并遵守相关规定。
定期核查信息：公司应定期核查手机卡信息的准确性和完整性，及时发现并处理存在的问题。
综上所述，解决公司员工离职后不愿配合进行手机卡实名制变更的问题，需要公司、员工和运营商三方的共同努力和配合。通过明确责任与义务、采取多种解决方案、加强预防措施等方式，可以有效降低此类问题的发生概率和风险。