关于年假扣全勤奖的问题，这确实是一个涉及劳动者权益的重要话题。首先，我们需要明确的是，年休假是《劳动法》明确规定职工所享有的法定假期，它不应被纳入“全勤”的考核范围之内。

一、年休假与全勤奖的关系

1. 年休假性质：年休假是职工依法享受的休息时间，是职工劳动权益的一部分。用人单位应当保证职工享受年休假，这是其法定义务。

2. 全勤奖定义：全勤奖通常是对职工在一定时期内（如一个月、一个季度或一年）无迟到、早退、旷工等行为的奖励。它是对职工出勤情况的认可，但不应与年休假相挂钩。

3. 法律规定：根据《武汉市员工工资支付条例》等相关规定，员工依法享受年休假等假期的，用人单位应当视为提供正常劳动并支付工资。这意味着，职工在休年休假期间，其工资待遇不受影响，全勤奖也不应因此被扣除。

二、用人单位扣全勤奖的合法性分析

1. 违法性：如果用人单位以职工休年休假为由扣除全勤奖，这种做法是违法的。因为年休假是职工的法定权利，用人单位无权因职工行使这一权利而对其进行惩罚或剥夺其应得的奖励。

2. 纠纷处理：如果职工遇到用人单位因休年休假而扣除全勤奖的情况，可以通过与用人单位协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等合法途径来维护自己的权益。

三、建议与措施

1. 职工方面：

   • 合理规划年休假：职工在规划年度休假时，应结合自身职业规划和用人单位的生产经营情况，合理安排年休假时间。
   • 保留相关凭证：妥善保管劳动合同、休假申请审批记录等凭证，以便在发生纠纷时能够证明自己的权益。
   • 及时维权：如果遇到工资被克扣、年休假权益被侵害等情况，应及时通过协商、投诉等合法途径维权。

2. 用人单位方面：

   • 加强制度合规性：用人单位应完善年休假管理制度，确保符合法律法规要求，避免因制度不合规而引发纠纷。
   • 统筹规划年休假：年初结合生产经营计划与员工需求，统筹规划年休假安排，引导员工分批休假，以减少因员工中途离职可能产生的年休假“超支”成本。
   • 沟通与提示：在员工申请提前休完全年年假时，进行必要的沟通与提示，明确年休假与全勤奖的关系，避免误解和纠纷。

综上所述，年假扣全勤奖的做法是不合法的。职工在享受年休假权利时，应做好合理规划，并保留好相关凭证；用人单位则应加强制度合规性，统筹规划年休假安排，并通过沟通与提示来减少纠纷的发生。