关于农村土地被划成基本农田的归属管理问题，这确实是一个涉及多个部门和层级的复杂体系。不过，我可以为您梳理出一个清晰的框架，帮助您理解并找到正确的负责部门。
首先，要明确的是，农村土地的管理是由国家、地方、村级等多个层面共同负责的。在基本农田的划定和管理上，主要涉及到以下几个关键部门：
县级及以上自然资源和规划部门：
- 这是农村土地管理的主要部门之一，负责土地资源的规划、管理、保护和合理利用。
- 在基本农田的划定上，自然资源和规划部门会根据国家的土地利用政策和规划，结合当地的实际情况，进行土地用途的划定和调整。
- 如果您想了解某块土地是否被划为基本农田，或者对基本农田的划定有疑问，可以首先联系当地的县级自然资源和规划部门。
农业农村局：
- 农业农村局在农村土地管理中也占有重要地位，特别关注与农业生产直接相关的事务。
- 虽然基本农田的划定主要由自然资源和规划部门负责，但农业农村局在土地承包、土地流转等农业生产相关事务上有着重要的管理职责。
- 如果您在基本农田的使用、承包或流转等方面遇到问题，也可以考虑联系农业农村局进行咨询。
乡镇人民政府：
- 乡镇人民政府是处理与农村集体土地相关日常事务的最基层机构。
- 在基本农田的管理上，乡镇政府会负责土地使用情况的日常监督，以及处理与基本农田相关的村民纠纷等问题。
- 如果您对基本农田的具体使用或管理有疑问，或者需要反映相关问题，可以直接联系当地的乡镇政府。
操作建议：
- 如果您想了解某块土地是否被划为基本农田，或者对基本农田的划定、管理有疑问，建议首先联系当地的县级自然资源和规划部门。
- 如果您在基本农田的使用、承包或流转等方面遇到问题，可以考虑联系农业农村局进行咨询。
- 如果您对基本农田的具体使用或管理有疑问，或者需要反映与基本农田相关的村民纠纷等问题，可以直接联系当地的乡镇政府。
综上所述，农村土地被划成基本农田的管理涉及多个部门，但您可以根据具体问题的性质和需求，选择联系最相关的部门进行咨询和申请。希望这个解答能够帮助您找到正确的负责部门，并解决您的问题。