结论：针对你借朋友信用卡刷了6000元，已归还但先扣了她另一张卡6000元的情况，你可以先与朋友沟通确认还款情况，再联系银行核实并解决问题，必要时可寻求法律帮助。以下是具体分析和建议：

一、与朋友沟通确认

1. 了解朋友情况：首先，你需要与朋友进行坦诚的沟通，了解她另一张卡被扣6000元的具体情况。询问她是否收到了银行的扣款通知，以及这笔扣款是否与你的还款行为有关联。

2. 确认还款记录：要求朋友提供还款记录或银行流水，以确认你归还的6000元是否已经成功到账，并了解另一张卡被扣款的具体原因。

二、联系银行核实

1. 查询还款情况：如果与朋友沟通后仍无法确定问题所在，你可以直接联系银行客服，提供你的信用卡信息和还款记录，查询你的还款是否已经成功处理，并了解另一张卡被扣款的原因。

2. 提出异议：如果银行确认你的还款已经成功，但另一张卡被扣款是由于银行错误或系统故障导致的，你可以向银行提出异议，要求银行撤销错误的扣款，并恢复你朋友的账户资金。

三、法律途径解决

1. 保留证据：在与银行沟通的过程中，务必保留好所有相关的证据，包括还款记录、银行流水、沟通记录等，以备不时之需。

2. 寻求法律帮助：如果银行拒绝撤销错误的扣款，或者你与银行之间无法就问题达成一致，你可以考虑寻求法律帮助。你可以咨询专业律师，了解你的权益和可能的法律途径，如起诉银行要求赔偿等。不过，在大多数情况下，通过与银行的积极沟通和协商，问题应该能够得到妥善解决，无需走到法律诉讼这一步。

四、预防措施

1. 明确还款方式：为了避免类似情况再次发生，建议你在未来使用信用卡时，明确还款方式，并确保还款资金能够准确、及时地到达指定账户。

2. 及时沟通：如果你发现还款过程中出现任何问题或异常，应及时与银行或信用卡持有人进行沟通，以便及时解决问题，避免造成不必要的麻烦和损失。

五、特殊情况考虑

• 如果朋友另一张卡被扣款是由于她自身的原因（如逾期未还其他债务、账户异常等），那么你需要与她协商解决，并可能需要承担一定的责任或协助她解决问题。不过，这种情况相对较少见，且通常与你的还款行为无直接关联。

六、总结与建议

• 在处理此类问题时，保持冷静和理性至关重要。不要因为情绪激动而做出冲动的决定或行为。
• 积极与银行和朋友沟通是解决问题的关键。通过沟通，你可以更好地了解问题的本质和原因，并找到最合适的解决方案。
• 如果问题无法得到妥善解决，不要害怕寻求法律帮助。法律是保护你权益的有力武器，你应该充分利用它来维护自己的合法权益。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。