中标公告期间与公司签订的协议是否有效，需根据具体情况判断，但通常情况下，只要协议内容合法、双方意思表示真实且不存在其他无效情形，该协议是有效的。以下从不同角度进行详细分析：
一、协议签订的时间点与中标公告的关系
中标公告发布前：
- 如果在中标公告发布前，双方已经就合同的主要条款达成一致，并签订了协议，这通常被视为预合同或意向书。只要该协议不违反法律法规的强制性规定，且双方意思表示真实，该协议在双方之间是具有法律约束力的。但需注意，此时中标结果尚未公布，若后续中标结果发生变化（如未中标），则该协议可能因无法履行或目的无法实现而面临解除或变更的风险。
中标公告发布后：
- 在中标公告发布后，双方签订协议通常是在确认中标结果的基础上进行的。此时，协议的内容往往与中标项目直接相关，且双方对协议条款已有充分了解和协商。只要协议内容合法、双方意思表示真实，且不存在欺诈、胁迫等无效情形，该协议是有效的。
二、协议有效的法律要件
主体适格：
- 签订协议的双方必须具备相应的民事行为能力，即能够独立承担民事责任的自然人、法人或其他组织。
意思表示真实：
- 双方签订协议时，必须基于真实的意思表示，不存在欺诈、胁迫、乘人之危等情形。
内容合法：
- 协议的内容必须符合法律法规的强制性规定，不得违反公序良俗或损害国家、集体、第三人的利益。
形式合法：
- 根据法律法规的规定，某些类型的合同必须采用书面形式或其他特定形式才能生效。若协议属于此类合同，则必须满足相应的形式要求。
三、可能影响协议效力的特殊情形
串通投标：
- 如果双方在中标过程中存在串通投标的行为，则中标结果可能被视为无效，进而影响后续签订的协议的效力。
违法分包或转包：
- 如果中标项目涉及违法分包或转包的情况，则相关协议可能因违反法律法规的强制性规定而被认定为无效。
协议内容存在重大误解或显失公平：
- 如果协议内容存在重大误解或显失公平的情况，受损方有权请求人民法院或仲裁机构变更或撤销该协议。
四、法律建议
审查协议内容：
- 在签订协议前，务必仔细审查协议内容，确保协议条款合法、明确、无歧义，并符合双方的真实意思表示。
了解中标过程：
- 了解中标过程的合法性和公正性，避免因中标过程存在问题而影响后续协议的效力。
咨询专业律师：
- 如有任何疑问或担忧，建议咨询专业律师，以获取更具体、更专业的法律意见。
综上所述，中标公告期间与公司签订的协议是否有效，需根据具体情况判断。只要协议内容合法、双方意思表示真实且不存在其他无效情形，该协议通常是有效的。但需注意，特殊情形下协议效力可能受到影响，因此建议在签订协议前进行充分的审查和咨询。如有任何法律问题，可直接向我咨询。